Se escapó de casa a los dieciséis años, en 1904, y marchó a Barcelona, donde subsistió repartiendo periódicos; fue maestro ocasional en una escuela ácrata, corredor de comercio y periodista en el diario que vendía, La Publicidad.
En París, en 1912, conoció a Rebecca Arié Behar, con quien se casó y con quien adoptó una hija, Encarnación.
[4] En 1959 concedió a Marino Gómez-Santos una larga entrevista publicada en el diario Pueblo y en ese mismo año fundó en Tuéjar, su pueblo natal, la Biblioteca Municipal que lleva su nombre y a la cual dio sus primeros 2000 libros; después siguió haciendo donaciones hasta su muerte.
A su muerte, quedó como presidente de la editorial su viuda y como consejero delegado gerente su sobrino Carlos Aguilar González.
En 2009 se creó en Tuéjar el Museo del Libro Manuel Aguilar Muñoz en su honor.