El mismo 19 de julio, antes del fallecimiento de Sanjurjo, el general Mola elaboró una lista ampliada del directorio militar, así como las primeras disposiciones a dictar.
Según el decreto número 1 hecho público un día después (25 de julio), la Junta asumía «todos los poderes del Estado y representa legítimamente al País ante las Potencias extranjeras».
[1] Al día siguiente, la Junta nombró a Francisco Franco jefe de las fuerzas sublevadas en el frente sur, y no fue hasta el 3 de agosto cuando se propuso su incorporación a la Junta como miembro, junto con los generales Gonzalo Queipo de Llano y Luis Orgaz.
A continuación se votó la designación y fue elegido Francisco Franco (que había estado a las órdenes de Cabanellas en África) como Jefe del Gobierno del Estado y Generalísimo de los Ejércitos manifestando Cabanellas que se abstenía de votar dada su posición contraria a la medida.
En 2005 desapareció finalmente la Junta pasando sus funciones al Consejo de Defensa Nacional.