Apoyó a Gamarra en su lucha contra la invasión boliviana de 1835 y tras su derrota en Yanacocha, emigró del país.

Falleció en Chile de manera misteriosa, cuando se preparaba para acompañar al Ejército Unido Restaurador en su lucha contra la Confederación Perú-Boliviana.

Logró huir, pero sus bienes fueron confiscados y debió permanecer oculto durante algunos años en la sierra.

[1]​ Al finalizar el dominio español en 1824, las nuevas autoridades republicanas tuvieron en cuenta su pasado revolucionario y le concedieron cargos públicos.

[6]​ Durante la rebelión del general gamarrista Pedro Pablo Bermúdez contra el presidente Luis de Orbegoso, tuvo una actitud indecisa, pese a estar comprometido con Gamarra, sin duda al ver la reacción del pueblo a favor de Orbegoso.

Puso también precio a las cabezas de los principales bandidos, entre ellos el célebre negro Pedro Escobar.

Pero estas medidas solo sirvieron para darle fama de sanguinario y la misma población las rechazó.

[16]​ Pero Bujanda no llegó a embarcarse rumbo al Perú, pues falleció repentinamente, en circunstancias misteriosas.

[17]​ Murió en plena madurez, cuando su ímpetu hacía presagiar que tendría un papel protagónico en la política peruana.