Además es famoso por su cruenta ejecución en Praga, a manos del bando católico, cuando se iniciaba la Guerra de los Treinta Años.
Estudió, sobre todo medicina, en Leipzig, Wittenberg (donde llegó a ser rector) y la Universidad de Padua.
El evento, que duró cinco días, ocasionó considerable revuelo y atrajo a cientos de espectadores.
[1] Dos años después se transforma en médico personal del emperador Rodolfo II, famoso mecenas de las ciencias, las artes y la alquimia, que antes había autorizado la autopsia pública de 1600.
Su captor, Fernando II, habría interpretado este anagrama como "Imperator Mathias Mense Martio Morietur" (en latín "El emperador Matías morirá en el mes de marzo").