[10] En el Apertura 2016 la joven promesa alba jugó 5 partidos y anotó 1 gol (175' min en cancha).
[12] El 14 de mayo por la decimocuarta fecha del Torneo de Clausura contra Deportes Antofagasta en el Estadio Monumental, ingresaría al minuto 60' por Octavio Rivero un cambio que causaría mucha polémica entre la semana cuando los albos ganaban por 1-0,[13] al minuto 87' tras un córner y mala salida de Salazar, Gonzalo Villagra anotó el 1-1 parcial silenciando el Monumental esto porque Club Social y Deportivo Colo-Colo le cedía el liderato a la "U" a una fecha del final quien sería finalmente la campeona del torneo.
[15] Tras no ser nominado al primer equipo durante las seis primeras fechas, Moralito debutó en el Torneo de Transición 2017 el 15 de octubre ante Santiago Wanderers por la novena fecha ingresando al entretiempo por Luis Pedro Figueroa, al minuto 80' asiste a Paredes para el 1-0 parcial y al 90+1' de partido el capitán le devuelve la asistencia para que Iván marque el 2-0 final en un trabajado triunfo albo y subiendo a la cima del torneo.
[17] El 5 de noviembre, CSD Colo-Colo jugaría un partido clave por el Torneo de Transición contra Unión Española por la fecha 12 del torneo en el Estadio Monumental, los "albos" tenían la misión de vencer a los hispanos para recuperar la punta después de que perdieran por la cuenta mínima ante Deportes Temuco la fecha anterior en polémico partido, al minuto 9' Octavio Rivero abrió la cuenta para los "albos", seis minutos después Claudio Baeza igualó para los "hispanos" por un autogol, al 32' Jaime Valdés anotó de penal para el 2-1 y al 37' el propio Morales asistió a Óscar Opazo para que este corriera un carreron y marcará el 3-1 parcial con el que se irían al descanso, al minuto 63' de partido tras otro contragolpe letal albo y tras un carreron de Rivero, Morales puso el cuarto batiendo a Diego "Mono" Sánchez, dos minutos después Sebastián Jaime anotó el después hispano y al 69' Valdés cerró la goleada marcando el 5-2 de penal, el gran partido de Morales finalizaría al 84' saliendo por Ricardo Álvarez bajo una ovación volviendo a recuperar la punta del torneo siendo líder junto con Unión Española y Universidad de Chile con 24 puntos, poniendo el torneo al rojo vivo a tres fechas del final,[18] en las tres siguientes jornadas ganarían sus tres partidos mientras que la Unión y la "U" cederían terreno, serían campeones en la última fecha venciendo Huachipato por 3-0 en el Estadio Ester Roa Rebolledo con goles de Valdés, Rivero y Orellana, Morales sería suplente en ese partido y no vería acción, como dato serían campeones con 33 puntos, dos más que el sublíder Unión Española.
[19] Jugaría 6 partidos por el Torneo de Transición siendo campeón marcando 3 goles y dando 2 asistencias estando 332' minutos en cancha.
[6] Finalmente, Chile sería eliminado en primera ronda tras perder ante Colombia por la cuenta mínima, quedando último en su grupo y penúltimo en toda la competición, solo superando a Perú, siendo esta, además, la peor participación chilena desde el Sudamericano de 1985, realizado en Paraguay.