En bioquímica, las isoenzimas son isoformas (variantes estrechamente relacionadas) de las enzimas.
En muchos casos, son codificadas por genes homólogos que han divergido con el tiempo.
Isoenzimas (y aloenzimas) son variantes de la misma enzima.
Sin embargo, estas diferencias suelen ser sutiles (particularmente entre las aloenzimas que a menudo son variantes neutrales).
Mientras que las isoenzimas pueden ser casi idénticas en cuanto a su funcionamiento, pueden diferir en otros aspectos.