Por instigación suya, Isabel llegó a Viena en 1782 y se educó en el convento salesiano.

La joven archiduquesa se convirtió en alumna de Salieri, quien le enseñó a cantar.

Para no asustarla con su palidez mortal, el emperador solo dejó que su habitación de enfermo se iluminara tenuemente cuando la recibió.

En la noche del 17 de febrero, tras un alumbramiento que resultó ser largo y difícil, dio a luz prematuramente a una niña mentalmente débil, la archiduquesa Luisa Isabel, el cerebro del bebé resultó seriamente dañado debido a que se tuvieron que utilizar fórceps, la bebé apenas sobrevivió un año y medio.

Dos días después falleció el emperador José II de Habsburgo.