Comprendía a los actuales departamentos de Lima, Ica, Junín, Huánuco y Ancash.

En el siglo XVII el puerto del Callao pasó a tener un gobernador militar nombrado por el rey.

Poco después -en 1787- la intendencia quedó en manos del virrey hasta 1805 cuando asumió Juan María Gálvez.

[4]​ Las siete intendencias originales del virreinato peruano se dividieron en 55 partidos, los cuales comprendían 483 doctrinas o parroquias y 977 anexos.

La distribución por intendencia era la siguiente: Lima 9 partidos, Trujillo 7, Arequipa 8, Tarma 9, Huancavelica 4, Huamanga 7 y Cuzco 11.