Era apreciado por sus buenas características a baja velocidad y de despegue corto que se necesitaban en su época.Después del tercer prototipo, se fabricaron diez aviones de preproducción en 1937.Fueron usados con bastante éxito en el ataque a Polonia, donse se probó como un fiable avión de observación y enlace.El Henschel era un remolcador más pequeño, comparado con el usual remolcador trimotor Junkers Ju 52, y tuvo que esforzarse para ganar altitud y salvar las montañas encontradas en su ruta.Un segundo Hs 126 fue derribado sobre el monte Smolikas, muriendo el Oficial Piloto Lazaros Papamichail y el Sargento Constantine Yemenetzis.
