Estos son característicos del grupo, junto con otras numerosas peculiaridades ultraestructurales, siendo la más notable la presencia de una varilla paraxial en cada flagelo.
[3] El carácter monofilético de Euglenozoa es generalmente aceptado, y se cree que están relacionados con Percolozoa, pues ambos comparten la característica de presentar mitocondrias con crestas discoidales, que sólo se presenta en unos pocos grupos,[4] y otros flagelados excavados.
La mayoría poseen cloroplastos y son fotosintéticos, mientras que otros se alimentan por fagocitosis o por pinocitosis.
También pertenecen a este grupo protozoarios del género Leishmania, agentes etiológicos de las leishmaniasis cutánea y visceral.
Son especialmente frecuentes en los hábitats marinos donde consumen detritus, algas y otras partículas de tamaño moderado.
Euglenida Symbiontida Diplonemida Kinetoplastida En este caso, el clado Glycomonada implicaría incluir heterótrofos con glicosomas y ancestralmente fagótrofos.