Los kinetoplástidos son organismos unicelulares, aunque como excepción Cephalothamnium forma una colonia sésil.
Estos organismos son comunes en el suelo, agua dulce o en ambientes marinos.
Entre los géneros de vida libre, destacan por su abundancia Neobodo y Bodo.
Los parásitos pueden tener ciclos de vida simples con un solo huésped o más complejos que comprenden varias etapas diferenciadas en dos huéspedes.
Este es un gránulo que contiene numerosas copias del genoma mitocondrial localizado en la única mitocondria y asociado a la base de los flagelos.