Calpaína

Las enzimas responsables de esta proteólisis fueron denominadas CAPN (calcium-activated neutral proteases).

No existe una única secuencia de aminoácidos específica que sea reconocida por las calpaínas.

En sus sustratos proteicos, la estructura terciaria más que la secuencia de aminoácidos es la responsable del reconocimiento y corte proteolítico.

Por lo que respecta a péptidos más pequeños, se ha detectado mayor especificidad hacia aminoácidos pequeños e hidrofóbicos (como leucina, valina e isoleucina) en posición P2, y aminoácidos grandes hidrofóbicos (como fenilalanina y tirosina) en la posición P1.

El mejor sustrato fluorogénico disponible para las calpaínas es (EDANS)-Glu-Pro-Leu-Phe=Ala-Glu-Arg-Lys-(DABCYL), en el que el corte se establece a nivel del enlace Phe=Ala.