Cecil Moss lo convocó a los Springboks por primera vez en 1989, como suplente de Johan Heunis y este fue el último partido del seleccionado durante el apartheid.
Con la abolición del anterior en 1992, el entrenador John Williams prefirió a Theo van Rensburg para el el regreso y demás compromisos.
Joubert la mantuvo hasta su retiro internacional en 1997, con los técnicos Andre Markgraaff y Carel du Plessis.
Es considerado el tercer mejor fullback de los años 1990, detrás del escocés Gavin Hastings y el australiano Matt Burke.
En el funeral, Joubert cargó el ataúd con Morné du Plessis, Francois Pienaar y familiares de van der Westhuizen.