El 2,5-hexanodiol es un líquido incoloro viscoso que tiene su punto de fusión a -9 °C —similar al del 3,4-hexanodiol pero inferior al del 1,6-hexanodiol— y su punto de ebullición a 217 °C.
Es miscible en agua; el valor calculado del logaritmo de su coeficiente de reparto, logP, varía ampliamente entre -0,33 y 0,62, por lo que su solubilidad puede ser algo mayor en disolventes hidrófobos —como el 1-octanol— que en disolventes hidrófilos.
[8] Asimismo, la reacción de Michael entre nitroetano y metilvinilcetona, llevada a cabo en medio acusoso, permite obtener este diol,[9] con un rendimiento del 60%.
La exposición a este compuesto provoca irritación en ojos, piel y vías respiratorias.
Además puede ser tóxico si se ingiere y puede ocasionar problemas en el sistema nervioso.