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Mutación

Un tulipán rojo que exhibe un pétalo parcialmente amarillo debido a una mutación en sus genes.
Mutación con doble floración en la Reserva Natural Langheck cerca de Nittel , Alemania

En biología , una mutación es una alteración en la secuencia de ácido nucleico del genoma de un organismo , virus o ADN extracromosómico . [1] Los genomas virales contienen ADN o ARN . Las mutaciones resultan de errores durante la replicación viral o del ADN , mitosis o meiosis u otros tipos de daño al ADN (como los dímeros de pirimidina causados ​​por la exposición a la radiación ultravioleta ), que luego pueden sufrir una reparación propensa a errores (especialmente la unión de extremos mediada por microhomología ). , [2] causar un error durante otras formas de reparación, [3] [4] o causar un error durante la replicación ( síntesis de translesión ). Las mutaciones también pueden resultar de la inserción o eliminación de segmentos de ADN debido a elementos genéticos móviles . [5] [6] [7]

Las mutaciones pueden producir o no cambios detectables en las características observables ( fenotipo ) de un organismo. Las mutaciones desempeñan un papel en procesos biológicos tanto normales como anormales, incluidos: la evolución , el cáncer y el desarrollo del sistema inmunológico , incluida la diversidad de las uniones . La mutación es la fuente última de toda variación genética , proporcionando la materia prima sobre la que pueden actuar fuerzas evolutivas como la selección natural .

La mutación puede dar lugar a muchos tipos diferentes de cambios en las secuencias. Las mutaciones en los genes pueden no tener ningún efecto, alterar el producto de un gen o impedir que el gen funcione adecuada o completamente. Las mutaciones también pueden ocurrir en regiones no genéticas . Un estudio de 2007 sobre variaciones genéticas entre diferentes especies de Drosophila sugirió que, si una mutación cambia una proteína producida por un gen, es probable que el resultado sea dañino; se estima que el 70% de los polimorfismos de aminoácidos tienen efectos dañinos, y el resto ser neutral o marginalmente beneficioso. [8] Debido a los efectos dañinos que las mutaciones pueden tener en los genes, los organismos tienen mecanismos como la reparación del ADN para prevenir o corregir mutaciones al revertir la secuencia mutada a su estado original. [5]

Descripción general

Las mutaciones pueden implicar la duplicación de grandes secciones de ADN, generalmente mediante recombinación genética . [9] Estas duplicaciones son una fuente importante de materia prima para la evolución de nuevos genes, con decenas a cientos de genes duplicados en genomas animales cada millón de años. [10] La mayoría de los genes pertenecen a familias de genes más grandes de ascendencia compartida, detectables por su homología de secuencia . [11] Los genes nuevos se producen mediante varios métodos, comúnmente mediante la duplicación y mutación de un gen ancestral, o recombinando partes de diferentes genes para formar nuevas combinaciones con nuevas funciones. [12] [13]

Aquí, los dominios proteicos actúan como módulos, cada uno con una función particular e independiente, que pueden mezclarse para producir genes que codifican nuevas proteínas con propiedades novedosas. [14] Por ejemplo, el ojo humano utiliza cuatro genes para crear estructuras que detectan la luz: tres para la visión de los conos o los colores y uno para los bastones o la visión nocturna; los cuatro surgieron de un único gen ancestral. [15] Otra ventaja de duplicar un gen (o incluso un genoma completo) es que esto aumenta la redundancia de ingeniería ; esto permite que un gen del par adquiera una nueva función mientras que la otra copia realiza la función original. [16] [17] Otros tipos de mutación ocasionalmente crean nuevos genes a partir de ADN que previamente no codificaba . [18] [19]

Los cambios en el número de cromosomas pueden implicar mutaciones aún mayores, donde segmentos del ADN dentro de los cromosomas se rompen y luego se reorganizan. Por ejemplo, en Homininae , dos cromosomas se fusionan para producir el cromosoma 2 humano ; esta fusión no ocurrió en el linaje de los otros simios , y conservan estos cromosomas separados. [20] En la evolución, el papel más importante de tales reordenamientos cromosómicos puede ser acelerar la divergencia de una población en nuevas especies al hacer que las poblaciones sean menos propensas a cruzarse, preservando así las diferencias genéticas entre estas poblaciones. [21]

Las secuencias de ADN que pueden moverse por el genoma, como los transposones , constituyen una fracción importante del material genético de plantas y animales y pueden haber sido importantes en la evolución de los genomas. [22] Por ejemplo, más de un millón de copias de la secuencia Alu están presentes en el genoma humano , y estas secuencias ahora han sido reclutadas para realizar funciones tales como la regulación de la expresión genética . [23] Otro efecto de estas secuencias de ADN móviles es que cuando se mueven dentro de un genoma, pueden mutar o eliminar genes existentes y, por lo tanto, producir diversidad genética. [6]

Las mutaciones no letales se acumulan dentro del acervo genético y aumentan la cantidad de variación genética. [24] La abundancia de algunos cambios genéticos dentro del acervo genético puede reducirse mediante selección natural , mientras que otras mutaciones "más favorables" pueden acumularse y dar lugar a cambios adaptativos.

Prodryas persephone , unamariposa del Eoceno tardío

Por ejemplo, una mariposa puede producir descendencia con nuevas mutaciones. La mayoría de estas mutaciones no tendrán ningún efecto; pero se podría cambiar el color de una de las crías de la mariposa, haciendo que sea más difícil (o más fácil) que los depredadores la vean. Si este cambio de color es ventajoso, las posibilidades de que esta mariposa sobreviva y produzca su propia descendencia son un poco mejores y, con el tiempo, la cantidad de mariposas con esta mutación puede formar un porcentaje mayor de la población.

Las mutaciones neutras se definen como mutaciones cuyos efectos no influyen en la aptitud de un individuo. Estos pueden aumentar en frecuencia con el tiempo debido a la deriva genética . Se cree que la inmensa mayoría de las mutaciones no tienen ningún efecto significativo sobre la aptitud de un organismo. [25] [26] Además, los mecanismos de reparación del ADN pueden reparar la mayoría de los cambios antes de que se conviertan en mutaciones permanentes, y muchos organismos tienen mecanismos para eliminar células somáticas que de otro modo estarían permanentemente mutadas .

Las mutaciones beneficiosas pueden mejorar el éxito reproductivo. [27] [28]

Causas

Cuatro clases de mutaciones son (1) mutaciones espontáneas (desintegración molecular), (2) mutaciones debidas a una replicación propensa a errores que evita daños naturales en el ADN (también llamada síntesis de translesión propensa a errores), (3) errores introducidos durante la reparación del ADN, y (4) mutaciones inducidas causadas por mutágenos . Los científicos también pueden introducir deliberadamente secuencias mutantes mediante la manipulación del ADN con fines de experimentación científica.

Un estudio de 2017 afirmó que el 66% de las mutaciones que causan cáncer son aleatorias, el 29% se deben al medio ambiente (la población estudiada abarcó 69 países) y el 5% son hereditarias. [29]

En promedio, los seres humanos transmiten 60 nuevas mutaciones a sus hijos, pero los padres transmiten más mutaciones dependiendo de su edad y cada año agregan dos nuevas mutaciones a un niño. [30]

Mutación espontánea

Las mutaciones espontáneas ocurren con una probabilidad distinta de cero incluso en una célula sana y no contaminada. Se estima que el daño oxidativo natural del ADN ocurre 10.000 veces por célula por día en humanos y 100.000 veces por célula por día en ratas . [31] Las mutaciones espontáneas se pueden caracterizar por el cambio específico: [32]

Omisión de replicación propensa a errores

Cada vez hay más pruebas de que la mayoría de las mutaciones que surgen espontáneamente se deben a una replicación propensa a errores ( síntesis de translesión ) después de un daño en el ADN en la cadena plantilla. En ratones , la mayoría de las mutaciones son causadas por síntesis de translesión. [35] Asimismo, en levadura , Kunz et al. [36] encontraron que más del 60% de las sustituciones y eliminaciones espontáneas de un solo par de bases fueron causadas por la síntesis de translesiones.

Errores introducidos durante la reparación del ADN.

Aunque las roturas de doble hebra que se producen de forma natural se producen con una frecuencia relativamente baja en el ADN, su reparación a menudo provoca mutaciones. La unión de extremos no homólogos (NHEJ) es una vía importante para reparar roturas de doble cadena. NHEJ implica la eliminación de algunos nucleótidos para permitir una alineación algo imprecisa de los dos extremos para volver a unirse, seguido de la adición de nucleótidos para llenar los espacios. Como consecuencia, NHEJ a menudo introduce mutaciones. [37]

Un aducto covalente entre el metabolito del benzo[ a ]pireno , el principal mutágeno del humo del tabaco , y el ADN [38]

mutación inducida

Las mutaciones inducidas son alteraciones en el gen después de que ha entrado en contacto con mutágenos y causas ambientales.

Las mutaciones inducidas a nivel molecular pueden ser causadas por:

Mientras que en épocas anteriores se suponía que las mutaciones ocurrían por casualidad o inducidas por mutágenos, se han descubierto mecanismos moleculares de mutación en bacterias y en todo el árbol de la vida. Como afirma S. Rosenberg, "Estos mecanismos revelan una imagen de mutagénesis altamente regulada, regulada temporalmente por respuestas al estrés y activada cuando las células/organismos no se adaptan a sus entornos, cuando están estresados, lo que potencialmente acelera la adaptación". [41] Dado que son mecanismos mutagénicos autoinducidos que aumentan la tasa de adaptación de los organismos, en ocasiones han sido denominados mecanismos de mutagénesis adaptativa e incluyen la respuesta SOS en bacterias, [42] la recombinación intracromosómica ectópica [43] y otros mecanismos mutagénicos autoinducidos que aumentan la tasa de adaptación de los organismos. eventos como duplicaciones. [41]

Clasificación de tipos

Por efecto sobre la estructura.

Cinco tipos de mutaciones cromosómicas
Tipos de mutaciones a pequeña escala

La secuencia de un gen se puede alterar de varias maneras. [44] Las mutaciones genéticas tienen diversos efectos sobre la salud dependiendo de dónde ocurren y si alteran la función de las proteínas esenciales. Las mutaciones en la estructura de los genes se pueden clasificar en varios tipos.

Mutaciones a gran escala

Las mutaciones a gran escala en la estructura cromosómica incluyen:

Mutaciones a pequeña escala

Las mutaciones a pequeña escala afectan un gen en uno o unos pocos nucleótidos. (Si solo un nucleótido se ve afectado, se denominan mutaciones puntuales ). Las mutaciones a pequeña escala incluyen:

Por impacto en la secuencia de proteínas.

Diagrama de la estructura de un gen codificador de proteínas eucariotas, que muestra regiones reguladoras, intrones y regiones codificantes. Se muestran cuatro etapas: ADN, producto de ARNm inicial, ARNm maduro y proteína.
La estructura de un gen codificador de proteínas eucariotas . Una mutación en la región codificante de proteínas (roja) puede provocar un cambio en la secuencia de aminoácidos. Las mutaciones en otras áreas del gen pueden tener diversos efectos. Los cambios dentro de las secuencias reguladoras (amarilla y azul) pueden afectar la regulación transcripcional y traduccional de la expresión génica .
Mutaciones puntuales clasificadas por impacto en las proteínas.
Selección de mutaciones que causan enfermedades, en una tabla estándar del código genético de aminoácidos [47]

El efecto de una mutación en la secuencia de una proteína depende en parte de en qué parte del genoma ocurre, especialmente si es en una región codificante o no codificante . Las mutaciones en las secuencias reguladoras no codificantes de un gen, como promotores, potenciadores y silenciadores, pueden alterar los niveles de expresión genética, pero es menos probable que alteren la secuencia de la proteína. Las mutaciones dentro de los intrones y en regiones sin función biológica conocida (por ejemplo, pseudogenes , retrotransposones ) son generalmente neutrales y no tienen ningún efecto sobre el fenotipo, aunque las mutaciones de los intrones podrían alterar el producto proteico si afectan el empalme del ARNm.

Es más probable que las mutaciones que ocurren en regiones codificantes del genoma alteren el producto proteico y pueden clasificarse por su efecto en la secuencia de aminoácidos:

Por efecto sobre la función

Una mutación se convierte en un efecto sobre la función cuando la exactitud de las funciones entre una proteína mutada y su interactor directo sufre un cambio. Los interactuantes pueden ser otras proteínas, moléculas, ácidos nucleicos, etc. Hay muchas mutaciones que se incluyen en la categoría de efecto sobre la función, pero dependiendo de la especificidad del cambio se producirán las mutaciones que se enumeran a continuación. [50]

Por efecto sobre la aptitud física (mutaciones dañinas, beneficiosas y neutras)

En genética , a veces es útil clasificar las mutaciones como dañinas o beneficiosas (o neutrales ):

Las pruebas de mutagénesis cuantitativa a gran escala , en las que se prueban miles de millones de mutaciones, invariablemente encuentran que una fracción mayor de mutaciones tiene efectos dañinos pero siempre arroja también una cantidad de mutaciones beneficiosas. Por ejemplo, en una evaluación de todas las deleciones genéticas en E. coli , el 80% de las mutaciones fueron negativas, pero el 20% fueron positivas, aunque muchas tuvieron un efecto muy pequeño sobre el crecimiento (dependiendo de la condición). [56] Las eliminaciones de genes implican la eliminación de genes completos, por lo que las mutaciones puntuales casi siempre tienen un efecto mucho menor. En una prueba similar en Streptococcus pneumoniae , pero esta vez con inserciones de transposones , el 76% de los mutantes de inserción se clasificaron como neutrales, el 16% tenía una aptitud significativamente reducida, pero el 6% eran ventajosos. [57]

Esta clasificación es obviamente relativa y algo artificial: una mutación dañina puede convertirse rápidamente en una mutación beneficiosa cuando las condiciones cambian. Además, existe un gradiente de dañino/beneficioso a neutral, ya que muchas mutaciones pueden tener efectos pequeños y en su mayoría insignificantes, pero bajo ciertas condiciones se volverán relevantes. Además, muchos rasgos están determinados por cientos de genes (o loci), de modo que cada locus tiene sólo un efecto menor. Por ejemplo, la altura humana está determinada por cientos de variantes genéticas ("mutaciones"), pero cada una de ellas tiene un efecto muy pequeño sobre la altura, [58] aparte del impacto de la nutrición . La altura (o el tamaño) en sí misma puede ser más o menos beneficiosa, como lo demuestra la enorme variedad de tamaños en los grupos de animales o plantas.

Distribución de efectos de aptitud (DFE)

Se han realizado intentos para inferir la distribución de los efectos de aptitud (DFE) utilizando experimentos de mutagénesis y modelos teóricos aplicados a datos de secuencias moleculares. El DFE, tal como se utiliza para determinar la abundancia relativa de diferentes tipos de mutaciones (es decir, fuertemente nocivas, casi neutrales o ventajosas), es relevante para muchas cuestiones evolutivas, como el mantenimiento de la variación genética , [59] la tasa de descomposición genómica , [60] el mantenimiento de la reproducción sexual cruzada en contraposición a la endogamia [61] y la evolución del sexo y la recombinación genética . [62] La DFE también se puede rastrear mediante el seguimiento de la asimetría de la distribución de mutaciones con efectos supuestamente graves en comparación con la distribución de mutaciones con efectos supuestamente leves o ausentes. [63] En resumen, el DFE juega un papel importante en la predicción de la dinámica evolutiva . [64] [65] Se han utilizado una variedad de enfoques para estudiar el DFE, incluidos métodos teóricos, experimentales y analíticos.

"La distribución de los efectos de aptitud (DFE) de las mutaciones en el virus de la estomatitis vesicular ". En este experimento, se introdujeron mutaciones aleatorias en el virus mediante mutagénesis dirigida y se comparó la aptitud de cada mutante con el tipo ancestral. Una aptitud de cero, menos de uno, uno, más de uno, respectivamente, indica que las mutaciones son letales, nocivas, neutrales y ventajosas. [66]

Uno de los primeros estudios teóricos sobre la distribución de los efectos de la aptitud fue realizado por Motoo Kimura , un influyente genetista teórico de poblaciones . Su teoría neutral de la evolución molecular propone que la mayoría de las mutaciones nuevas serán muy nocivas y una pequeña fracción será neutral. [25] [77] Una propuesta posterior de Hiroshi Akashi propuso un modelo bimodal para el DFE, con modos centrados en mutaciones neutrales y altamente nocivas. [78] Ambas teorías coinciden en que la gran mayoría de las nuevas mutaciones son neutrales o nocivas y que las mutaciones ventajosas son raras, lo que ha sido respaldado por resultados experimentales. Un ejemplo es un estudio realizado sobre la DFE de mutaciones aleatorias en el virus de la estomatitis vesicular . [66] De todas las mutaciones, el 39,6% fueron letales, el 31,2% fueron nocivas y no letales y el 27,1% fueron neutrales. Otro ejemplo proviene de un experimento de mutagénesis de alto rendimiento con levadura. [71] En este experimento se demostró que el DFE general es bimodal, con un grupo de mutaciones neutras y una amplia distribución de mutaciones nocivas.

Aunque relativamente pocas mutaciones son ventajosas, aquellas que lo son desempeñan un papel importante en los cambios evolutivos. [79] Al igual que las mutaciones neutras, las mutaciones ventajosas débilmente seleccionadas pueden perderse debido a la deriva genética aleatoria, pero es más probable que las mutaciones ventajosas fuertemente seleccionadas se solucionen. Conocer el DFE de mutaciones ventajosas puede conducir a una mayor capacidad para predecir la dinámica evolutiva. John H. Gillespie [80] y H. Allen Orr han realizado trabajos teóricos sobre el DFE para mutaciones ventajosas . [81] Propusieron que la distribución de mutaciones ventajosas debería ser exponencial en una amplia gama de condiciones, lo que, en general, ha sido respaldado por estudios experimentales, al menos para mutaciones ventajosas fuertemente seleccionadas. [82] [83] [84]

En general, se acepta que la mayoría de las mutaciones son neutras o perjudiciales, siendo raras las mutaciones ventajosas; sin embargo, la proporción de tipos de mutaciones varía entre especies. Esto indica dos puntos importantes: primero, es probable que la proporción de mutaciones efectivamente neutrales varíe entre especies, como resultado de la dependencia del tamaño efectivo de la población ; en segundo lugar, el efecto promedio de las mutaciones nocivas varía dramáticamente entre especies. [24] Además, el DFE también difiere entre regiones codificantes y regiones no codificantes , y el DFE del ADN no codificante contiene mutaciones más débilmente seleccionadas. [24]

Por herencia

Una mutación ha provocado que esta planta de rosa musgosa produzca flores de diferentes colores. Esta es una mutación somática que también puede transmitirse en la línea germinal .

En organismos multicelulares con células reproductivas dedicadas , las mutaciones se pueden subdividir en mutaciones de la línea germinal , que pueden transmitirse a los descendientes a través de sus células reproductivas, y mutaciones somáticas (también llamadas mutaciones adquiridas), [85] que involucran células fuera del grupo reproductivo dedicado y que no suelen transmitirse a la descendencia.

Los organismos diploides (p. ej., los humanos) contienen dos copias de cada gen: un alelo paterno y otro materno. Según la aparición de mutaciones en cada cromosoma, podemos clasificar las mutaciones en tres tipos. Un organismo no mutado homocigoto o de tipo salvaje es aquel en el que ninguno de los alelos está mutado.

mutación de la línea germinal

Una mutación de la línea germinal en las células reproductivas de un individuo da lugar a una mutación constitucional en la descendencia, es decir, una mutación que está presente en todas las células. Una mutación constitucional también puede ocurrir muy poco después de la fertilización , o continuar a partir de una mutación constitucional previa en uno de los padres. [87] Una mutación de la línea germinal se puede transmitir a través de generaciones posteriores de organismos.

La distinción entre mutaciones de línea germinal y somáticas es importante en animales que tienen una línea germinal dedicada a producir células reproductivas. Sin embargo, tiene poco valor para comprender los efectos de las mutaciones en las plantas, que carecen de una línea germinal específica. La distinción también se desdibuja en aquellos animales que se reproducen asexualmente mediante mecanismos como la gemación , porque las células que dan origen a los organismos hijos también dan lugar a la línea germinal de ese organismo.

Una nueva mutación de la línea germinal que no se hereda de ninguno de los padres se denomina mutación de novo .

Mutación somática

Un cambio en la estructura genética que no se hereda de uno de los padres y tampoco se transmite a la descendencia se denomina mutación somática . [85] Las mutaciones somáticas no son heredadas por la descendencia de un organismo porque no afectan la línea germinal . Sin embargo, se transmiten a toda la descendencia de una célula mutada dentro del mismo organismo durante la mitosis. Por lo tanto, una sección importante de un organismo podría portar la misma mutación. Este tipo de mutaciones suelen ser provocadas por causas ambientales, como la radiación ultravioleta o cualquier exposición a ciertas sustancias químicas nocivas, y pueden causar enfermedades como el cáncer. [88]

En las plantas, algunas mutaciones somáticas se pueden propagar sin necesidad de producir semillas, por ejemplo, mediante injertos y esquejes de tallo. Este tipo de mutaciones han dado lugar a nuevos tipos de frutas, como la manzana "Delicious" y la naranja ombligo "Washington" . [89]

Las células somáticas humanas y de ratón tienen una tasa de mutación más de diez veces mayor que la tasa de mutación de la línea germinal para ambas especies; Los ratones tienen una tasa más alta de mutaciones somáticas y germinales por división celular que los humanos. La disparidad en la tasa de mutación entre la línea germinal y los tejidos somáticos probablemente refleja la mayor importancia del mantenimiento del genoma en la línea germinal que en el soma. [90]

clases especiales

Nomenclatura

Para categorizar una mutación como tal, la secuencia "normal" debe obtenerse del ADN de un organismo "normal" o "sano" (a diferencia de uno "mutante" o "enfermo"), debe identificarse y reportado; Idealmente, debería ponerse a disposición del público para una comparación sencilla nucleótido por nucleótido, y ser acordado por la comunidad científica o por un grupo de genetistas y biólogos expertos , quienes tienen la responsabilidad de establecer el estándar o el llamado "consenso". secuencia. Este paso requiere un tremendo esfuerzo científico. Una vez que se conoce la secuencia consenso, se pueden identificar, describir y clasificar las mutaciones en un genoma. El comité de la Sociedad de Variación del Genoma Humano (HGVS) ha desarrollado la nomenclatura estándar de variantes de secuencia humana, [97] que deberían utilizar los investigadores y los centros de diagnóstico de ADN para generar descripciones de mutaciones inequívocas. En principio, esta nomenclatura también puede utilizarse para describir mutaciones en otros organismos. La nomenclatura especifica el tipo de mutación y los cambios de bases o aminoácidos.

Tasas de mutación

Las tasas de mutación varían sustancialmente entre especies, y las fuerzas evolutivas que generalmente determinan la mutación son objeto de investigación en curso.

En los seres humanos , la tasa de mutación es de aproximadamente 50 a 90 mutaciones de novo por genoma por generación, es decir, cada ser humano acumula alrededor de 50 a 90 mutaciones nuevas que no estaban presentes en sus padres. Este número se ha establecido secuenciando miles de tríos humanos, es decir, dos padres y al menos un hijo. [98]

Los genomas de los virus de ARN se basan en ARN en lugar de ADN. El genoma viral de ARN puede ser bicatenario (como en el ADN) o monocatenario. En algunos de estos virus (como el virus de inmunodeficiencia humana monocatenario ), la replicación se produce rápidamente y no existen mecanismos para comprobar la precisión del genoma. Este proceso propenso a errores a menudo resulta en mutaciones.

La tasa de mutaciones de novo, ya sean de línea germinal o somáticas, varía entre organismos. [99] Los individuos dentro de la misma especie pueden incluso expresar diferentes tasas de mutación. [100] En general, las tasas de mutaciones de novo son bajas en comparación con las de mutaciones heredadas, lo que las clasifica como formas raras de variación genética . [101] Muchas observaciones de tasas de mutación de novo han asociado tasas más altas de mutación correlacionadas con la edad paterna. En los organismos que se reproducen sexualmente, la frecuencia comparativamente mayor de divisiones celulares en la línea germinal del donante de esperma de los padres lleva a la conclusión de que las tasas de mutación de novo pueden rastrearse sobre una base común. La frecuencia de error durante el proceso de replicación del ADN de la gametogénesis , especialmente amplificada en la rápida producción de espermatozoides, puede promover más oportunidades para que las mutaciones de novo se repliquen sin estar reguladas por la maquinaria de reparación del ADN. [102] Esta afirmación combina los efectos observados de una mayor probabilidad de mutación en la espermatogénesis rápida con cortos períodos de tiempo entre divisiones celulares que limitan la eficiencia de la maquinaria de reparación. [103] Las tasas de mutaciones de novo que afectan a un organismo durante su desarrollo también pueden aumentar con ciertos factores ambientales. Por ejemplo, ciertas intensidades de exposición a elementos radiactivos pueden dañar el genoma de un organismo, aumentando las tasas de mutación. En los seres humanos, la aparición de cáncer de piel durante la vida es inducida por la sobreexposición a la radiación ultravioleta que provoca mutaciones en el genoma celular y de la piel. [104]

Aleatoriedad de las mutaciones.

Existe una suposición generalizada de que las mutaciones son (completamente) "aleatorias" con respecto a sus consecuencias (en términos de probabilidad). Se demostró que esto era incorrecto, ya que la frecuencia de las mutaciones puede variar entre regiones del genoma, y ​​dicha reparación del ADN y los sesgos de las mutaciones se asocian con varios factores. Por ejemplo, se descubrió que regiones biológicamente importantes estaban protegidas de mutaciones y que las mutaciones beneficiosas para la planta estudiada eran más probables, es decir, la mutación "no es aleatoria de una manera que beneficia a la planta". [105] [106] Además, se ha demostrado que los experimentos anteriores que normalmente se utilizan para demostrar que las mutaciones son aleatorias con respecto a la aptitud (como la prueba de fluctuación y el revestimiento de réplicas ) solo respaldan la afirmación más débil de que esas mutaciones son aleatorias con respecto a la selectividad externa. limitaciones, no la aptitud en su conjunto. [107]

Causación de la enfermedad

Los cambios en el ADN causados ​​por una mutación en una región codificante del ADN pueden provocar errores en la secuencia de proteínas que pueden dar como resultado proteínas parcial o completamente no funcionales. Cada célula, para funcionar correctamente, depende de miles de proteínas para funcionar en los lugares correctos en el momento correcto. Cuando una mutación altera una proteína que desempeña un papel fundamental en el cuerpo, puede producirse una afección médica. Un estudio sobre la comparación de genes entre diferentes especies de Drosophila sugiere que si una mutación cambia una proteína, lo más probable es que la mutación sea dañina; se estima que el 70 por ciento de los polimorfismos de aminoácidos tienen efectos dañinos y el resto es neutro o neutro. débilmente beneficioso. [8] Algunas mutaciones alteran la secuencia de bases del ADN de un gen, pero no cambian la proteína producida por el gen. Los estudios han demostrado que sólo el 7% de las mutaciones puntuales en el ADN no codificante de la levadura son perjudiciales y el 12% en el ADN codificante son perjudiciales. El resto de mutaciones son neutras o ligeramente beneficiosas. [108]

Trastornos hereditarios

Si una mutación está presente en una célula germinal , puede dar lugar a una descendencia que porta la mutación en todas sus células. Este es el caso de las enfermedades hereditarias. En particular, si hay una mutación en un gen de reparación del ADN dentro de una célula germinal, los humanos que portan dichas mutaciones de la línea germinal pueden tener un mayor riesgo de cáncer. En el artículo Trastorno por deficiencia de reparación del ADN se proporciona una lista de 34 de estas mutaciones de la línea germinal . Un ejemplo de uno es el albinismo , una mutación que se produce en el gen OCA1 u OCA2 . Las personas con este trastorno son más propensas a muchos tipos de cáncer, otros trastornos y tienen problemas de visión.

El daño del ADN puede provocar un error cuando se replica el ADN, y este error de replicación puede provocar una mutación genética que, a su vez, podría provocar un trastorno genético. Los daños al ADN son reparados por el sistema de reparación del ADN de la célula. Cada célula tiene una serie de vías a través de las cuales las enzimas reconocen y reparan daños en el ADN. Debido a que el ADN puede dañarse de muchas maneras, el proceso de reparación del ADN es una forma importante en la que el cuerpo se protege de las enfermedades. Una vez que el daño del ADN ha dado lugar a una mutación, ésta no se puede reparar.

Papel en la carcinogénesis

Por otro lado, puede ocurrir una mutación en una célula somática de un organismo. Estas mutaciones estarán presentes en todos los descendientes de esta célula dentro del mismo organismo. La acumulación de ciertas mutaciones a lo largo de generaciones de células somáticas es parte de la causa de la transformación maligna , de célula normal a célula cancerosa. [109]

Las células con mutaciones heterocigotas con pérdida de función (una copia buena del gen y una copia mutada) pueden funcionar normalmente con la copia no mutada hasta que la copia buena haya mutado somáticamente de forma espontánea. Este tipo de mutación ocurre a menudo en organismos vivos, pero es difícil medir la tasa. Medir esta tasa es importante para predecir la tasa a la que las personas pueden desarrollar cáncer. [110]

Las mutaciones puntuales pueden surgir de mutaciones espontáneas que ocurren durante la replicación del ADN. La tasa de mutación puede verse incrementada por mutágenos. Los mutágenos pueden ser físicos, como la radiación de los rayos ultravioleta , los rayos X o el calor extremo, o químicos (moléculas que colocan mal los pares de bases o alteran la forma helicoidal del ADN). Los mutágenos asociados con el cáncer a menudo se estudian para aprender sobre el cáncer y su prevención.

Mutaciones beneficiosas

Aunque las mutaciones que provocan cambios en las secuencias de proteínas pueden ser perjudiciales para un organismo, en ocasiones el efecto puede ser positivo en un entorno determinado. En este caso, la mutación puede permitir que el organismo mutante resista tensiones ambientales particulares mejor que los organismos de tipo salvaje, o se reproduzca más rápidamente. En estos casos una mutación tenderá a volverse más común en una población mediante selección natural. Los ejemplos incluyen los siguientes:

Resistencia al VIH : una deleción específica de 32 pares de bases en el CCR5 humano ( CCR5-Δ32 ) confiere resistencia al VIH a los homocigotos y retrasa la aparición del SIDA en los heterocigotos. [111] Una posible explicación de la etiología de la frecuencia relativamente alta de CCR5-Δ32 en la población europea es que confirió resistencia a la peste bubónica en la Europa de mediados del siglo XIV . Las personas con esta mutación tenían más probabilidades de sobrevivir a la infección; así aumentó su frecuencia en la población. [112] Esta teoría podría explicar por qué esta mutación no se encuentra en el sur de África , que permaneció intacta por la peste bubónica. Una teoría más reciente sugiere que la presión selectiva sobre la mutación CCR5 Delta 32 fue causada por la viruela en lugar de por la peste bubónica. [113]

Resistencia a la malaria : un ejemplo de mutación dañina es la anemia falciforme , un trastorno sanguíneo en el que el cuerpo produce un tipo anormal de hemoglobina, una sustancia que transporta oxígeno, en los glóbulos rojos . Un tercio de todos los habitantes indígenas del África subsahariana son portadores del alelo porque, en zonas donde la malaria es común, tener un solo alelo de células falciformes ( rasgo de células falciformes ) tiene un valor de supervivencia para sobrevivir . [114] Aquellos con solo uno de los dos alelos de la anemia falciforme son más resistentes a la malaria, ya que la infestación de la malaria Plasmodium se detiene mediante la formación de células falciformes que infesta.

Resistencia a los antibióticos : Prácticamente todas las bacterias desarrollan resistencia a los antibióticos cuando se exponen a antibióticos. De hecho, las poblaciones bacterianas ya tienen mutaciones que se seleccionan mediante la selección de antibióticos. [115] Obviamente, tales mutaciones solo son beneficiosas para las bacterias, pero no para las personas infectadas.

Persistencia de la lactasa . Una mutación permitió a los humanos expresar la enzima lactasa después de ser destetados naturalmente de la leche materna, lo que permitió a los adultos digerir la lactosa , que es probablemente una de las mutaciones más beneficiosas en la evolución humana reciente . [116]

Mutaciones priónicas

Los priones son proteínas y no contienen material genético. Sin embargo, se ha demostrado que la replicación de priones está sujeta a mutación y selección natural al igual que otras formas de replicación. [117] El gen humano PRNP codifica la principal proteína priónica, PrP, y está sujeto a mutaciones que pueden dar lugar a priones que causan enfermedades.

Papel en la evolución

Al introducir nuevas cualidades genéticas en una población de organismos, las mutaciones de novo desempeñan un papel fundamental en las fuerzas combinadas del cambio evolutivo. Sin embargo, el peso de la diversidad genética generada por el cambio mutacional a menudo se considera una fuerza evolutiva generalmente "débil". [100] Aunque la aparición aleatoria de mutaciones por sí sola proporciona la base para la variación genética en toda la vida orgánica, esta fuerza debe tomarse en consideración junto con todas las fuerzas evolutivas en juego. Las mutaciones espontáneas de novo como eventos cataclísmicos de especiación dependen de factores introducidos por la selección natural , el flujo genético y la deriva genética . Por ejemplo, las poblaciones más pequeñas con fuertes aportaciones mutacionales (altas tasas de mutación) son propensas a aumentos de variación genética que conducen a la especiación en generaciones futuras. Por el contrario, las poblaciones más grandes tienden a ver menores efectos de los rasgos mutados recién introducidos. En estas condiciones, las fuerzas selectivas disminuyen con el tiempo la frecuencia de los alelos mutados, que en la mayoría de los casos son perjudiciales. [118]

Desviaciones patógenas compensadas.

Las desviaciones patogénicas compensadas se refieren a residuos de aminoácidos en una secuencia de proteínas que son patógenos en una especie pero que son residuos de tipo salvaje en la proteína funcionalmente equivalente en otra especie. Aunque el residuo de aminoácido es patógeno en la primera especie, no lo es en la segunda especie porque su patogenicidad se compensa con una o más sustituciones de aminoácidos en la segunda especie. La mutación compensatoria puede ocurrir en la misma proteína o en otra proteína con la que interactúa. [119]   

Es fundamental comprender los efectos de las mutaciones compensatorias en el contexto de mutaciones perjudiciales fijas debido a la disminución de la aptitud de la población debido a la fijación. [120] El tamaño efectivo de la población se refiere a una población que se está reproduciendo. [121] Un aumento en el tamaño de esta población se ha correlacionado con una menor tasa de diversidad genética. [121] La posición de una población en relación con el tamaño de la población de efecto crítico es esencial para determinar el efecto que los alelos nocivos tendrán sobre la aptitud física. [120] Si la población está por debajo del tamaño efectivo crítico, la aptitud física disminuirá drásticamente; sin embargo, si la población está por encima del tamaño del efecto crítico, la aptitud física puede aumentar independientemente de las mutaciones nocivas debidas a los alelos compensatorios. [120]

Mutaciones compensatorias en el ARN.

Como la función de una molécula de ARN depende de su estructura, [122] la estructura de las moléculas de ARN se conserva evolutivamente. Por tanto, cualquier mutación que altere la estructura estable de las moléculas de ARN debe ser compensada por otras mutaciones compensatorias. En el contexto del ARN, la secuencia del ARN puede considerarse como "genotipo" y la estructura del ARN puede considerarse como su "fenotipo". Dado que los ARN tienen una composición relativamente más simple que las proteínas, la estructura de las moléculas de ARN se puede predecir computacionalmente con un alto grado de precisión. Debido a esta conveniencia, las mutaciones compensatorias se han estudiado en simulaciones computacionales utilizando algoritmos de plegamiento de ARN. [123] [124]

Mecanismo evolutivo de compensación.

Las mutaciones compensatorias pueden explicarse por el fenómeno genético epistasis por el cual el efecto fenotípico de una mutación depende de las mutaciones en otros loci. Si bien la epistasis se concibió originalmente en el contexto de la interacción entre diferentes genes, recientemente también se ha estudiado la epistasis intragénica. [125] La existencia de desviaciones patogénicas compensadas puede explicarse por una 'epistasis de signos', en la que los efectos de una mutación perjudicial pueden compensarse con la presencia de una mutación epistática en otros loci. Para una proteína determinada, se puede considerar una mutación perjudicial (D) y una mutación compensatoria (C), donde C puede estar en la misma proteína que D o en una proteína que interactúa diferente según el contexto. El efecto de aptitud de C en sí mismo podría ser neutral o algo perjudicial, de modo que todavía pueda existir en la población, y el efecto de D es perjudicial en la medida en que no pueda existir en la población. Sin embargo, cuando C y D coexisten, el efecto de aptitud combinado se vuelve neutral o positivo. [119] Por lo tanto, las mutaciones compensatorias pueden aportar novedad a las proteínas al forjar nuevas vías de evolución de las proteínas: permite a los individuos viajar de un pico de aptitud física a otro a través de los valles de menor aptitud física. [125] 

DePristo et al. 2005 esbozó dos modelos para explicar la dinámica de las desviaciones patogénicas compensatorias (DPC). [126] En la primera hipótesis, P es una mutación de aminoácido patógena y C es una mutación compensatoria neutra. [126] En estas condiciones, si la mutación patogénica surge después de una mutación compensatoria, entonces P puede fijarse en la población. [126] El segundo modelo de CPD establece que P y C son mutaciones nocivas que resultan en valles de aptitud cuando las mutaciones ocurren simultáneamente. [126] Utilizando datos disponibles públicamente, Ferrer-Costa et al. 2007 obtuvieron conjuntos de datos de mutaciones compensatorias y mutaciones patógenas humanas que se caracterizaron para determinar las causas de las EPC. [127] Los resultados indican que las limitaciones estructurales y la ubicación en la estructura de la proteína determinan si se producirán mutaciones compensadas. [127]

Evidencia experimental de mutaciones compensatorias.

experimento en bacterias

Lunzer et al. [128] probaron el resultado del intercambio de aminoácidos divergentes entre dos proteínas ortólogas de la isopropimalato deshidrogenasa (IMDH). Sustituyeron 168 aminoácidos en IMDH de Escherichia coli que son residuos de tipo salvaje en IMDH de Pseudomonas aeruginosa . Descubrieron que más de un tercio de estas sustituciones comprometían la actividad enzimática IMDH en el fondo genético de Escherichia coli . Esto demostró que estados de aminoácidos idénticos pueden dar lugar a diferentes estados fenotípicos dependiendo del origen genético. Corrigan et al. 2011 demostró cómo Staphylococcus aureus podía crecer normalmente sin la presencia de ácido lipoteicoico debido a mutaciones compensatorias. [129] Los resultados de la secuenciación del genoma completo revelaron que cuando la fosfodiesterasa cíclica-di-AMP (GdpP) se interrumpió en esta bacteria, compensó la desaparición del polímero de la pared celular, lo que resultó en un crecimiento celular normal. [129]

Las investigaciones han demostrado que las bacterias pueden adquirir resistencia a los medicamentos a través de mutaciones compensatorias que no impiden o tienen poco efecto sobre la aptitud física. [130] Investigaciones anteriores de Gagneux et al. 2006 descubrió que las cepas de M. tuberculosis cultivadas en laboratorio con resistencia a la rifampicina tienen una aptitud reducida; sin embargo, las cepas clínicas resistentes a los medicamentos de esta bacteria patógena no tienen una aptitud reducida. [131] Comas y otros. 2012 utilizó comparaciones del genoma completo entre cepas clínicas y mutantes derivados de laboratorio para determinar el papel y la contribución de las mutaciones compensatorias en la resistencia a los medicamentos a la rifampicina. [130] El análisis del genoma revela que las cepas resistentes a la rifampicina tienen una mutación en rpoA y rpoC. [130] Un estudio similar investigó la aptitud bacteriana asociada con mutaciones compensatorias en Escherichia coli resistente a la rifampicina. [132] Los resultados obtenidos de este estudio demuestran que la resistencia a los medicamentos está relacionada con la aptitud bacteriana, ya que los costos más altos de aptitud están relacionados con mayores errores de transcripción. [132]

experimento en virus

Gong et al. [133] recopilaron datos genotípicos obtenidos de la nucleoproteína de la influenza de diferentes líneas de tiempo y los ordenaron temporalmente según su momento de origen. Luego aislaron 39 sustituciones de aminoácidos que ocurrieron en diferentes líneas de tiempo y las sustituyeron en un trasfondo genético que se aproximaba al genotipo ancestral. Descubrieron que 3 de las 39 sustituciones redujeron significativamente la idoneidad del origen ancestral. Las mutaciones compensatorias son mutaciones nuevas que surgen y tienen un impacto positivo o neutral en la aptitud de una población. [134] Investigaciones anteriores han demostrado que las poblaciones pueden compensar mutaciones perjudiciales. [119] [134] [135] Burch y Chao probaron el modelo geométrico de evolución adaptativa de Fisher probando si el bacteriófago φ6 evoluciona en pequeños pasos. [136] Sus resultados mostraron que la aptitud del bacteriófago φ6 disminuyó rápidamente y se recuperó en pequeños pasos. [136] Se ha demostrado que las nucleoproteínas virales evitan los linfocitos T citotóxicos (CTL) mediante sustituciones de arginina por glicina. [137] Estas mutaciones de sustitución afectan la aptitud de las nucleoproteínas virales; sin embargo, las comutaciones compensatorias impiden la disminución de la aptitud y ayudan al virus a evitar el reconocimiento de los CTL. [137] Las mutaciones pueden tener tres efectos diferentes; las mutaciones pueden tener efectos nocivos, algunas aumentan la aptitud física a través de mutaciones compensatorias y, por último, las mutaciones pueden contrarrestarse y dar como resultado mutaciones neutrales compensatorias. [138] [132] [131]

Aplicación en la evolución humana y las enfermedades.

En el genoma humano, la frecuencia y las características de las mutaciones de novo se han estudiado como factores contextuales importantes de nuestra evolución. En comparación con el genoma humano de referencia, un genoma humano típico varía aproximadamente entre 4,1 y 5,0 millones de loci, y la mayor parte de esta diversidad genética es compartida por casi el 0,5% de la población. [139] El genoma humano típico también contiene entre 40.000 y 200.000 variantes raras observadas en menos del 0,5% de la población que solo pueden haber ocurrido a partir de al menos una mutación de novo de la línea germinal en la historia de la evolución humana. [140] También se ha investigado que las mutaciones de novo desempeñan un papel crucial en la persistencia de enfermedades genéticas en humanos. Con los avances recientes en la secuenciación de próxima generación (NGS), se pueden estudiar directamente todos los tipos de mutaciones de novo dentro del genoma, cuya detección proporciona una gran comprensión de las causas de trastornos genéticos tanto raros como comunes. Actualmente, la mejor estimación de la tasa promedio de mutación del SNV de la línea germinal humana es 1,18 x 10^-8, con aproximadamente ~78 nuevas mutaciones por generación. La capacidad de realizar la secuenciación del genoma completo de padres e hijos permite comparar las tasas de mutación entre generaciones, reduciendo las posibilidades de origen de ciertos trastornos genéticos. [141]

Ver también

Referencias

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