John H. Gillespie es un biólogo evolutivo interesado en la genética de poblaciones teórica y la evolución molecular . En la evolución molecular, enfatizó la importancia de las mutaciones ventajosas y la selección equilibradora . Por esa razón, Gillespie es bien conocido por su postura seleccionista en el debate neutralista-seleccionista . Es ampliamente considerado el principal defensor de la selección natural en la evolución molecular . Tuvo una conocida disputa con el padre de la teoría neutral de la evolución molecular , Motoo Kimura , iniciada por una revisión de 1984 en Science del libro de Kimura en el que Gillespie criticó a Kimura por "usar el libro como un vehículo para establecerse un nicho en la historia de la ciencia". Gillespie tuvo solo cuatro estudiantes de doctorado durante su carrera: Richard Hudson, James N. McNair, David J. Cutler y Andrew Kern, pero fue mentor de muchos más. Gillespie fue profesor en la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad de California, Davis hasta su jubilación en 2005.