Posteriores versiones fueron lanzados en teléfonos móviles, consola virtual, PlayStation Network, iOS, Android y Microsoft Windows.
Chrono Trigger presenta otros rasgos únicos en su modo juego, incluyendo el viaje a través del tiempo.
A lo largo del juego se encontrarán nuevos aliados, completarán aventuras periféricas y buscarán importantes villanos.
Square posteriormente utilizó el mismo concepto de New Game + en otros títulos como Vagrant Story, Chrono Cross, Parasite Eve y Final Fantasy X-2.
Marle es en realidad la princesa Nadia del reino de Gardia: una joven activa y aventurera, que frecuentemente tiene problemas con su padre, el rey.
Del año 2300 d. C. proviene Robo, un robot con una agradable y curiosa personalidad, inicialmente creado para asistir a los humanos.
Cuando aún era un niño, una distorsión temporal causada por Lavos destruyó su reino y lo envió al año 600 d. C., donde fue encontrado por una criatura llamada Ozzie.
Es un parásito alienígena que llegó a la tierra en el año 65 000 000 a. C. Fue bautizado por Ayla, quien lo nombró de ese modo en su lengua antigua —La significando «fuego»; y Vos, «grande»—.
El joven aparece en un bosque, y tras encontrar un pueblo cercano se da cuenta de que viajó 400 años al pasado.
[20] Momentos después, Marle sufre de grandes dolores, y luego, se desvanece en el aire ante Crono.
Con la ayuda de una rana humanoide parlante llamada «Frog», Crono y Lucca descubren que la reina Leene fue secuestrada por los Mystics: criaturas demoníacas con inteligencia semi-humana gobernadas por el hechicero Magus.
En ese momento, el profeta misterioso revela ser Magus e intenta destruir al alienígena, pero es derrotado, y todos sus poderes son absorbidos.
[26] Intentando salvar la vida de sus compañeros, Crono se enfrenta a la criatura, pero muere y su cuerpo es vaporizado.
Los aventureros pronto escapan y derrotan a Dalton en una batalla sobre la rediseñada Epoch, la cual usan para accidentalmente destruir la "Ave negra" durante la fuga.
Sus antiguos generales, dándose cuenta de que él solo estaba utilizando a los Mystics, los atacan, pero mueren tras ser derrotados.
Esta se encuentra en los restos subterráneos del fuerte de los Reptites —preservado desde su destrucción en el 65 000 000 a. C.—, pero es demasiado pesada para poder retirarla por sí solos, por lo que piden ayuda al rey Gardia XXI, quién la guarda en su castillo.
A todo esto sigue la confrontación final con Lavos mismo, en la cual deben primero penetrar la coraza de la criatura.
Una vez dentro descubren que Lavos había estado cosechando el ADN del planeta mientras absorbía la energía producida.
Además, si Magus se había unido al equipo, les revela que planea buscar a su hermana perdida, Schala.
Si Epoch no fue destruido durante el ataque a Lavos, la madre de Crono accidentalmente entra al portal temporal de la feria justo antes que este se cierre, causando que Crono, Marle y Lucca despeguen en la Epoch hacia otra aventura para encontrarla, mientras los fuegos artificiales iluminan el cielo nocturno.
Además, la primera vez que aparece la "profecía oscura", se activa dos portales del "Santuario perdido", uno por cada época, en donde los Reptites son perseguidos por monstruos más fuertes y el objetivo es rescatarlos.
Crono, quien muere a manos de Lavos en 12000 a. C., queda atrapado en el continuum espacio-tiempo y sus amigos ponen todo su esfuerzo en revivirlo —o mejor dicho, en evitar que muera—.
[38] Dicho esbozo fue subsecuentemente editado y terminado por Masato Kato, que escribió todos los acontecimientos de la era 12.000 a. C. del juego.
Siendo un programador de sonido en ese momento, Mitsuda estaba descontento con su paga y amenazó con dejar Square si no podía componer música.
[44] Hironobu Sakaguchi sugirió que intentará con Chrono Trigger y comentó: "tal vez tu salario suba".
[45] Mitsuda compuso nueva música y se basó en una colección personal de piezas compuestas durante los dos años anteriores.
[44] Mitsuda durmió en su estudio varias noches y atribuyó ciertas piezas, como el tema final del juego, To Far Away Times, a sueños inspiradores.
Tsuyoshi Sekito compuso cuatro piezas nuevas para las características adicionales del juego que no estaban incluidas en la banda sonora.
PlayStation Magazine lo describió como «original y extremadamente cautivante», expresando una respuesta particularmente favorable por sus gráficos, sonido e historia.
El cuarto título, Radical Dreamers: Nusumenai Hōseki, es una historia paralela a Chrono Trigger creada para resolver una subtrama inconclusa de su predecesor.