En 1027, Hardeknut fue el primero en ser proclamado rey, y en 1657 la asamblea jugó su último papel en la sucesión monárquica al reconocer a Cristián V como príncipe heredero.
A principios del siglo XIV el rey Erico VI construyó una fortaleza en una colina entre los dos lagos de la ciudad para asegurar su influencia en la asamblea local.
La fortaleza fue destruida en 1319, cuando el hermano de Erik, Cristóbal II, ascendió al trono.
El movimiento luterano en Dinamarca propiamente dicha comenzó en Viborg cuando Hans Tausen vivió en la ciudad entre 1525 y 1529.
La antigua iglesia dominica fue el primer templo donde se permitió oficiar misa luterana.
Desde la época medieval hasta el siglo XVIII Viborg fue un centro comercial desde donde se exportaba ganado vacuno y caballar al norte de lo que actualmente es Alemania.
Tomó mucho tiempo para que la ciudad se levantara de esta catástrofe.
A mediados del siglo XIX Viborg quedó conectada a la red ferroviaria danesa, con la línea Langå-Skive, y posteriormente se abrieron las líneas Viborg-Herning y Viborg-Mariager.
La industria textil dominó la economía durante la mayor parte del siglo XX, pero el comercio, y sobre todo la administración y los servicios, incrementaron fuertemente su influencia desde la década de 1960 hasta llegar a constituir la principal fuente de empleo a finales del siglo XX y principios del XXI.
Fue quemada hasta los cimientos y ha sido reconstruida en numerosas ocasiones, siendo la cripta lo único que se conserva de la catedral original.
La catedral es famosa por las pinturas del pintor danés Joakim Skovgaard, que representan historias de la Biblia.
El edificio actual fue construido en 1926, para dar cabida a un mayor número de estudiantes.
La escuela, que logró el reconocimiento oficial del gobierno danés en 2003, ofrece a los estudiantes una Licenciatura en Artes en la animación de personajes.