Su nombre significa "lugar de María" y su historia inicia con un monasterio brigidino del siglo XV.

A mediados del siglo XV se estableció un convento de monjas brigidinas llamado Mariager Kloster.

Durante el siglo XVIII la ciudad exportaba una pequeña cantidad de cereal a Noruega y producía brændevin.

Además, Mariager no estuvo conectada a la red ferroviaria sino hasta 1927, cuando se inauguró una línea privada hacia Viborg.

Otra importarte fuente de empleos es una institución para discapacitados fundada en 1940.