Casó con el rey Antíoco VIII Gripo y fue reina del Imperio seléucida (124-111 a. C.).
A menudo se supone que Trifena también llevaba el nombre Cleopatra, pero esto no ha sido atestiguado.
En 124 a. C. Ptolomeo VIII ya no apoyaba al pretendiente al trono seléucida, Alejandro II Zabinas, sino a Antíoco VIII Gripo, el hijo de Demetrio II Nicátor y Cleopatra Tea.
Trifena odiaba a su hermana Cleopatra IV, que se había refugiado en el templo de Apolo, y la buscaba para matarla.
Un año más tarde (111 a. C.), Trifena fue hecha prisionera por Antíoco IX, después de que éste hubiera batido a su hermano en otra batalla.