Fue fray Julián Garcés miembro de esta orden quien fue nombrado como primer obispo de Tlaxcala con sede en Puebla y el primero que tuvo América quien concedió a sus religiosos, en la recién fundada ciudad, unos solares destinados para su Iglesia Mayor.
Según Carrión, el templo se comenzó en 1571 para terminarse, excepto la cúpula y la torre, en 1611.
La planta es una nave en forma de cruz latina, sin cúpula, el transepto conduce a la suntuosa Capilla del Rosario.
Está flanqueada por dos perros con una antorcha en el hocico y un globo entre los pies, símbolo de su fundador.
El amplio patio fue enlosado de laja labrada en 1780 y antiguamente estaba cercado con paredes.