[4]​ Su primer titular fue César Albiñana García-Quintana,[5]​ responsable los primeros meses de poner en marcha el órgano.

La estructura primigenia del órgano es desconocida, ya que solo se sabe que mediante una orden ministerial comunicada del 4 de julio de 1957, se le adscribieron algunos servicios dispersos en el Departamento.

Asimismo, se creó una Sección Administrativa para aquellos trabajos de carácter administrativo no técnico, así como la gestión del registro, archivos, habilitación, personal y otros asuntos que se le encargasen.

[9]​ Un año más tarde, en 1969, se lleva a cabo una leve reforma.

[12]​ Igualmente, se suprimió la Junta Central de Asistencia Técnica Tributaria.

[14]​[15]​ En 1974 se le vuelve a adscribir la Subdirección General de Relaciones Fiscales Internacionales.

[16]​ Ese año y el siguiente sufrirá cambios, sin mayor relevancia, en los órganos inferiores al nivel de subdirección general.

[17]​ Una vez iniciada la transición hacia la democracia, los órganos y organismos estatales empiezan a orientarse al ámbito internacional, sobre todo con el objetivo de entrar en la Comunidad Económica Europea (CEE).

[27]​ Desde 2012, se ha mantenido la independencia ministerial entre las carteras de Hacienda y Economía.