Sin embargo, reiteradamente, el Klamath se ha querido ver como una fuente potencial de agua debido a su generoso caudal, una rareza en la mayor parte del estado californiano.
Las cabeceras del Klamath, sin embargo, nacen en la alejada región de Crater Lake o el límite entre Oregón y Nevada.
Allí, discurre hacia el suroeste sobre rápidos de aguas bravas en el Bosque Nacional Klamath, recibiendo al río Salmon, y pasando por la comunidad no incorporada de Orleans.
La confluencia con el Trinity también marca el punto donde la corriente del Klamath reduce notablemente su velocidad.
La boca y las secciones próximas del río se ven afectadas por el oleaje provocado por los tsunamis oceánicos, lo que ha provocado algunas muertes durante los tsunamis del Pacífico de 1964 y de 2011.
El Klamath es uno de los pocos ríos que comienzan al este de las Cascadas y que desemboca en el océano Pacífico; los otros son los ríos Columbia y Fraser.
A pesar de que todos los pantanos han sido desecados, salvo el lago Upper Klamath,[24] la región sigue sustentando, en promedio, 3,7 millones de aves migratorias al año.
Los estiramientos de la corteza y las fallas en bloques han creado una topografía con características similares en ambas regiones.
A gran profundidad en la cuenca alta se encuentra un amplio sistema geotérmico, con la creación de fuentes termales y manantiales artesianos, pero su funcionamiento aún no se entiende bien.
A medida que la placa Norteamericana se movía lentamente en los últimos 10 millones de años hacia el suroeste, sucesivas terrenos oceánicos que datan desde el Cámbrico hasta finales del Jurásico se fueron añadiendo al continente norteamericano.
Existen cuatro terranos tectonoestratográficos distintos de oeste a este.
[32] En lugar de ser desviado hacia el sur, sin embargo, el Klamath continuó fluyendo hacia el oeste, y creó un desfiladero de paredes escarpadas que atraviesa la cordillera emergente.
Los asentamientos humanos en el Klamath datan de al menos 7000 años atrás.
La primera partida que vio el río, en el invierno de 1826-1827, estaba dirigida por Alexander McLeod.
En 1828 Jedediah Smith informó que había signos de castores en la desembocadura del río Klamath.
[39] En pocos años, los abundantes castores en la cuenca del Klamath habían sido en su mayoría aniquilados.
Se cree que el oro proviene de la actividad volcánica en las montañas Klamath.
Las compañías ferroviarias Great Northern Railway y Southern Pacific Railroad construyeron una línea de uso común que corría a lo largo de la costa oriental del lago, transportando los troncos desde la parte norte hasta el aserradero localizado a unos 4,8 km aguas abajo de la desembocadura del lago.
Muchos de los pantanos estacionales que rodean el lago y los ríos fueron desecados en ese período para dar espacio a operaciones madereras.
[47] Cuando la industria maderera entró en declive en la cuenca alta del Klamath, se produjo una lenta transición a la economía agrícola.
Esas presas, sin embargo, provocaron una gran controversia sobre la calidad del agua en el tramo inferior del río y sobre la migración anual de salmones que dependen de ella.
Históricamente, el río Klamath fue en su momento el «tercer sistema fluvial más productivo de salmón en los Estados Unidos» ( "third most productive salmon river system in the United States") después del Columbia y el Sacramento.
Los ambientalistas se opusieron a la extensión, argumentando que las represas deben ser removidas para reabrir el Klamath superior al salmón.
La aprobación del Congreso y el electorado de California también son necesarios.
Si este proyecto sigue adelante, sería el de mayor envergadura hasta la fecha.
[52] La posible eliminación de las presas ha sido un tema polémico en la región en los últimos años.
El vicepresidente Dick Cheney intervino personalmente para asegurar el agua para la industria agrícola en lugar de garantizar el caudal ecológico.
[61] En 2002 el gobierno federal, conforme a lo ordenado por el Secretario del Interior, Gale Norton, proveyó toda el agua que los regantes necesitaran mientras continuase la sequía, a pesar de que las tribus del área del Klamath tienen derechos emados de tratados que son anteriores al asentamiento de los agricultores.
[62][63] Ese año, el sistema del río Klamath tuvo la mayor mortandad de peces que jamás se haya registrado.
Los debates sobre esa práctica, que perturba las camas de desove del salmón, continúan hasta la fecha.