En esa ciudad conoce a Francisco Bilbao y Manuel Antonio Matta, empapándose de las nuevas ideas liberales de la época inspiradas en Francia.

A mediados del siglo XIX construyó una fundición de cobre y muelle en Totoralillo Norte, cuyos restos aún se conservan en la costa.

Vencido en esta última, se refugió en el destierro hasta 1862 en que regresó del Perú.

En 1879 al declararse el estado de guerra con la alianza Peruana-Boliviana cooperó con la formación del batallón "Coquimbo" N°1, incorporando a las filas de la patria a numerosos trabajadores de sus faenas mineras contribuyendo además con su indumentaria y equipamiento.

Luego contrae matrimonio con Nieves Campaña Ossandón, con la cual tiene dos hijos llamados Roberto y Pedro.

En 2010 la Sociedad Patrimonial presentó a la opinión pública nacional el libro Revolución Constituyente 1859-2009: Tributo a Pedro Pablo Muñoz Godoy, comandante de los igualitarios, que ha sido uno de los libros de historia más vendidos en la IV Región.