Hijo de Malatesta da Verucchio y Margareta Paltonieri.
A la muerte del papa Bonifacio VIII, en 1304, capturó Pesaro, Fano, Senigallia y Fossombrone.
[1] En julio de 1306 los fanesi se levantaron y, con la ayuda de las tropas papales de Bertrando di Got, obligaron a Malatesta a abandonar la ciudad; en agosto Pésaro y Senigallia se rebelaron mientras Fano, Forlì, Imola y Faenza se preparaban para una acto anti-malatesta.
Pandolfo se confirmó como uno de los máximos representantes del güelfismo en Romaña, distinguiéndose por su valor y tenacidad en la lucha armada contra los gibelinos.
En 1322, realizó asignaciones en Monte Fano, Montechiaro, Monte Granaro, San Giusto, Ascoli, acumulando un crédito de paga militar equivalente a 2700 florines de oro.