Una vez establecido en San José, Pío Víquez inició sus estudios en Derecho en la Universidad de Santo Tomás.
Ese mismo año, el presidente Tomás Guardia Gutiérrez lo nombró subsecretario del Ministerio de Relaciones Exteriores, Instrucción Pública, Justicia, Culto y Beneficencia.
Dos años después, retornó a la enseñanza en el Instituto Nacional de San José.
Durante este periodo, tuvo a su cargo la dirección de la Imprenta Nacional en varias oportunidades.
A su regreso al país, escribió un libro sobre el viaje que fue publicado en 1887, Relación del viaje del señor presidente de Costa Rica general don Bernardo Soto a la República de Nicaragua.
"¿Porqué tan triste, torcaz te lamentas cabe el nido y con acento sentido hondo un ¡ay!
Es uno de los autores clásicos del país, junto a los poetas de la Lira costarricense, Lisímaco Chavarría, Roberto Brenes Mesén, Carlos Gagini, Ricardo Fernández Guardia, Manuel Argüello Mora, Aquileo Echeverría y Manuel González Zeledón "Magón".
Uno de sus temas reiterativos es la igualdad entre todos los costarricenses, cuya única jerarquía es definida por el trabajo.
En las descripciones de sus viajes, Pío Víquez describe las regiones del territorio nacional que visita con el mismo asombro como lo haría un escritor extranjero.
Con su cuidada prosa, Víquez condensa en sus escritos el pensamiento de una época, la del liberalismo, que en la actualidad sirve para explicar el origen de muchos estereotipos y mitos del país y sus habitantes.