Durante sus primeros años contó con directores como Hans Winderstein, Hermann Zumpe y Ferdinand Löwe, quienes aseguraron un alto nivel técnico en sus interpretaciones, además de mostrar un interés entusiasta por el arte contemporáneo.
Felix Weingartner fue su director musical desde 1898 hasta 1905 y el joven Wilhelm Furtwängler dirigió la Sinfonía n.º 9 de Anton Bruckner en su debut como director al frente de esta orquesta, en 1906.
Durante este tiempo, la orquesta (que en 1910 empezó a ser conocida como la Orchester des Münchner Konzertvereins) se financió mediante fondos privados, pero tras el estallido de la Primera Guerra Mundial los fondos dismunuyeron considerablemente.
Debido a la negativa del maestro para grabar discos, los aficionados que deseasen escuchar una de sus interpretaciones al frente de la orquesta debían asistir presencialmente a los conciertos.
Después de un largo procedimiento legal, en 1983 los tribunales le dieron la razón y logró recibir el mismo salario que sus colegas masculinos y fue restituida como primera solista titular.
Entre 2004 y 2011, la dirección titular la ostentó el berlinés Christian Thielemann, con Zubin Mehta como principal director invitado.
Desde el inicio de la temporada 2012-2013, el director titular fue el norteamericano Lorin Maazel.