Los conquistadores españoles adoptaron este nombre, junto con otros municipios del departamento, como Anapoima, Anolaima, Sasaima y Nocaima.

Su nombre deriva del cacique Anamayo Nimaima, quien gobernaba la región a la llegada de los españoles.

Los Nimaimas estuvieron asentados en Nocaima desde la fundación en 1605, junto con los Chapaimilla, Pinzaima, Calamoima y Ubima.

Por el año 1621 ya tenían su propio pueblo en el que vivían 186 indios repartidos en 5 reducciones.

También se puede apreciar el cultivo de árboles frutales como la mandarina (en sus diversas clases), el mardoño, la naranja, el chontaduro o cachipay, marañón.