El Museo Naval de San Fernando es una institución pública que tiene como objetivo difundir la historia de la presencia de la Armada Española en San Fernando (Cádiz).

Tiene su sede desde 2015 en el edificio de la Antigua Capitanía General de la Zona Marítima del Estrecho, entrada por la calle Escaño.

[2]​ El edificio donde se encontraba (edificio Carlos III) era el mismo en el que se sitúa actualmente la Escuela de Suboficiales de San Fernando, en la Población militar de San Carlos, junto al Panteón de Marinos Ilustres y cerca del Hospital militar de San Carlos.

[3]​ En 2015, el museo se trasladó al centro de la ciudad, al edificio de la Antigua Capitanía General de la Zona Marítima del Estrecho, entrada por la calle Escaño.

En 2009, en su antigua ubicación, el Museo Naval isleño contaba con 21 salas que repasaban la historia militar española:[4]​