Sus padres habían acordado de antemano que sus hijos sería criados en la fe luterana, la religión de su padre, y las hijas en el catolicismo, la fe de su madre.

Su madre fue la segunda esposa del duque, la infanta María Antonia de Portugal, hija del exiliado rey Miguel I de Portugal.

En 1939, la familia huyó de los nazis y se refugió en España.

Margarita murió un día después de su cumpleaños número 97, en el 69 cumpleaños de su hija Ana.

Sigue siendo el miembro más longevo que ha tenido de la Casa Real danesa.