En 1957 los intereses coloniales cambiaron debido a que Gran Bretaña producía caucho sintético y ya no necesitaba los recursos del territorio, por lo que decidió darle la independencia y dejar el gobierno en manos de Tunku Abdul Rahman.
Ya a mediados del siglo XVIII se podían encontrar firmas británicas comerciando en la península de Malaca.
El nuevo Sultán, sintiéndose desesperado, le ofreció a Light la isla de Penang como recompensa por la ayuda militar.
La Compañía le ordenó a Light apoderarse de Penang, pero sin garantizar la ayuda militar que el Sultán pedía.
Finalmente la compañía decidió no enviar ninguna ayuda, y el Sultán, sintiéndose traicionado, expulsó a Light de Penang.
En 1800 Kedah cedió Prai a los británicos y el Sultán recibió 4.000 pesos adicionales como renta anual.
Penang fue más tarde bautizada Isla del Príncipe de Gales, mientras que Prai fue rebautizada Provincia Wellesley.
Los países en guerra han perdido grandes bienes que estaban al servicio de la colectividad, y sobre todo, han perdido vidas humanas que ya no se recuperan Antes del final del siglo XIX los británicos practicaron una política de no intervención.
Con la ayuda del Temenggung, Hussein abandonó Penyengat simulando irse de pesca, y llegó a Singapur, donde fue instalado rápidamente como Sultán.
Los administradores de las Colonias no estaban satisfechos con la forma en que Calcuta manejaba sus asuntos y se quejaron en Londres.
La Compañía incluso había intentado anular el estatuto de "puerto libre" del que gozaba Singapur desde 1856.
En el nuevo acuerdo, Siam acordaba renunciar a su soberanía sobre Kedah, Perlis, Terengganu y Kelantan, mientras que Pattani permanecía en territorio siamés.
Al mismo tiempo Europa pasaba por la Revolución Industrial y esto creó una enorme demanda de estaño.
Estos dos grupos trataron de aumentar regularmente su influencia en Perak y esto dio lugar a frecuentes escaramuzas.
Estas escaramuzas fueron descontrolándose, y ni siquiera Ngah Ibrahim, el Menteri Besar (equivalente a un primer ministro), podía estabilizar la situación.
Mientras tanto, se estaba llevando a cabo una lucha por el poder en la corte real de Perak.
A pesar de esto, Raja Abdullah no estuvo presente durante el entierro del Sultán Alí.
Raja Abdullah estaba furioso y se negó a aceptar la noticia de buena gana.
Tras la llegada de Clarke a Singapur, muchos comerciantes británicos, incluido Read, se hicieron cercanos al gobernador.
Junto con Perak, Selangor al sur tenía grandes depósitos de estaño en torno a Hulu Selangor en el norte, Hulu Klang en el área central y Lukut cerca de Negeri Sembilan al sur.
Más tarde en 1872, Dato' Kelana murió, y a principios de 1873, su antiguo mentor, Sayid Abdul Rahman, se erigió como el nuevo Yamtuan Besar.
Sin embargo, la mayoría de ellos fueron liberados durante la Segunda Guerra Mundial, cuando los japoneses invadieron y ocuparon Malaya.
Sin embargo, el proyecto nunca se materializó debido a la súbita rendición japonesa después del bombardeo de Hiroshima y Nagasaki.
Perlis, Kedah, Kelantan y Terengganu fueron entregadas por Siam a los Estados No Federados después del Tratado anglo-siamés de 1909.
En el período 1942-45 las posiciones japonesas en Borneo fueron bombardeadas por las fuerzas aéreas aliadas, con ataques devastadores en Sandakan y Labuan.
Diecisiete bombarderos de la Armada Imperial Japonesa atacaron Singapur, el primer ataque aéreo destinado a la colonia.
Japón recompensó a Tailandia por su cooperación durante la guerra cediéndole el estado malayo de Kedah.
No pasó mucho tiempo para que el Ejército japonés se dirigiera hacia su próximo objetivo, la ciudad de Kuala Lumpur.
Cuando la Fuerza llegó al puente en Sulong Parit, que se encontraba en manos del enemigo, Anderson, con creciente número de muertos y heridos, ordenó "sálvese quien pueda".
La administración británica apodó al conflicto la Emergencia Malaya, un juego legal para evitar las cuestas de una guerra oficial.