La editorial Houbunsha ha publicado una adaptación a serie de manga ilustrado por Hanokage que cubre los eventos de la historia, así como dos spin-offs, Puella Magi Kazumi Magica: The Innocent Malice y Puella Magi Oriko Magica.
Una revista dedicada, Manga Time Kirara Magica, comenzó a publicarse en junio de 2012.
[7] En la ciudad ficticia de Mitakihara, Japón, una estudiante de secundaria llamada Madoka Kaname y su mejor amiga, Sayaka Miki, se encuentran con una pequeña criatura parecida a un gato llamada Kyubey.
Mientras tanto, una estudiante transferida y una misteriosa chica mágica llamada Homura Akemi intenta evitar que Madoka haga el contrato con Kyubey.
Al notar su indecisión sobre si convertirse en una chica mágica, Mami se ofrece a llevar a Madoka y Sayaka con ella en su cacería de brujas para que puedan aprender sobre las responsabilidades de ser una chica mágica.
Madoka también descubre que las chicas mágicas entregan sus almas para formar Gemas del Alma, la fuente de su magia.
[10] Kyubey le revela a Madoka que pertenece a una raza alienígena que ha estado recolectando las emociones de las chicas mágicas durante siglos para usarlas como energía para contrarrestar la propagación de la entropía y así evitar la muerte térmica del universo.
Madoka y Kyōko intentan revertir la transformación de Sayaka, pero el plan falla y Kyōko se ve obligada a sacrificarse para permitir que Madoka escape, dejando a Homura como la única chica mágica restante.
Después de esto, una bruja extremadamente poderosa conocida como Walpurgisnacht se acerca a la ciudad.
Ella pide un deseo para detener la creación de todas las brujas en el pasado, presente y futuro.
Homura promete seguir luchando en honor a Madoka y al mundo que ella apreciaba.
[12] Este se puso en contacto con Gen Urobuchi de Nitroplus, para trabajar en el proyecto como guionista y con Ume Aoki para diseñar los personajes.
Nota: En Alemania e Italia se emitió doblado en sus respectivos idiomas La banda sonora de la serie está compuesta por Yuki Kajiura.
[22] Además, en una entrevista a Atsuhiro Iwakami se confirmó que no sería una sola película, sino una trilogía.
La tercera película, titulada Rebellion, presentaba una continuación a la historia plenamente original escrita por Urobuchi y tuvo su estreno en otoño de 2013.
The Rebellion Story fue preseleccionada para la nominación a los #86 Premios Oscars de la Academia.
Sin embargo sólo llegó hasta la ronda final, quedando fuera de las nominaciones.
La historia trata sobre una Puella Magi llamada Oriko, que por sucesos dados en esa línea del tiempo se convierte en una chica mágica.
[25] La historia sigue a una chica llamada Kazumi que ha perdido la memoria después de haber sido presuntamente secuestrada.
[29] El primer volumen de una antología oficial, Puella Magi Madoka☆Magica Anthology Comic Vol.
)[48] Puella Magi Madoka Magica Official Guidebook "You Are Not Alone"[49] Puella Magi Madoka Magica Production Note[50] El primer volumen BD vendió 53,000 copias en su primera semana, 22,000 de las cuales se vendieron el primer día, rompiendo el récord del sexto volumen BD de Bakemonogatari.
[56] La misma semana, el también primer volumen de Puella Magi Kazumi Magica: The Innocent Malice quedó en quinta posición con 59,728 copias vendidas.