Uno de sus trabajos más importantes es The SoulTaker (2001), donde empezó a desarrollar su propio estilo como director.

También en 2004, Shinbo fue contratado por Seven Arcs para trabajar en Triangle Heart y su popular spin-off, Mahō Shōjo Lyrical Nanoha.

[1]​ Junto con Shin Ōnuma y Tatsuya Oishi, Shinbo fue contratado por el nuevo director jefe de Shaft Mitsutoshi Kubota, como "supervisor", director, y "educador" de los nuevos miembros del estudio.

[2]​ Esto llevó a la creación de Puella Magi Madoka Magica, que Shinbo dirigió en 2011.

En primavera del mismo año, Shinbo dirigió Denpa Onna to Seishun Otoko, basado en una serie de novelas ligeras.