"Shiko" es el color púrpura en japonés, color que alude a Kioto ser por siglos la "Ciudad Imperial", capital del país hasta 1868, y que ha sido retenido al cambio de nombre.Cuando se creó la J. League, Kyoto Shiko no entró a formar parte de ella debido a la falta de patrocinadores, por lo que pasó a participar en la semiprofesional Japan Football League (antigua JFL) bajo un nuevo nombre: Kyoto Purple Sanga.La palabra Sanga está en sánscrito y significa "grupo" o "club", frecuentemente usada para denotar las congregaciones budistas.Tras terminar segundo en 1995 decidió pasar al profesionalismo, para lo que contó con el apoyo económico de empresas como Kyocera, Kyoto Bank o Nintendo.Pero no contaba con el suficiente dinero para poder formar una plantilla competitiva, por lo que en sus primeras temporadas Purple Sanga terminó en las últimas posiciones.