Juan Pérez de Cabrera
La Corona dispuso finalmente crear la Audiencia de los Confines y suprimir las gobernaciones.En los meses siguientes se le concedieron varios privilegios y exenciones para facilitar su expedición.Sin embargo, debido a que Pérez de Cabrera anunció su propósito de conquistar Nuevo Cartago y Costa Rica «a fuego y a sangre», el 31 de diciembre de 1549 una real cédula dispuso que no entrara a conquistar y poblar esa provincia hasta que la Real Audiencia de los Confines le diera instrucciones de cómo proceder para evitar, conforme a las Leyes Nuevas, que los indígenas sufrieran agravio, daño y molestias, y quedando prohibido que se les tomaran por la fuerza sus bienes.Tomó posesión del gobierno de Honduras en 1552 y lo ejerció hasta su fallecimiento en 1555.Según manifestó el cronista Bernal Díaz del Castillo en su Historia verdadera de la conquista de la Nueva España, «ni hizo mal ni bien».