Sufrió dos ataques por parte del kanato de Bujará, pero luego le cedió Taskent, que los rusos querían anexionarse.Aprovechando una revuelta interna el general ruso Mijaíl Skóbelev dirigió una ofensiva sobre el kanato de Kokand en 1876.En 1841, el capitán británico Arthur Conolly no logró persuadir a los diversos kanatos para que dejaran de lado sus diferencias, en un intento de contrarrestar la creciente penetración del Imperio ruso en el área.Durante este período, las tribus kirguisas también se separaron y formaron el kanato Kara-Kirguiso bajo el liderazgo de Ormon Khan.Cuando Alimqul fue asesinado en 1865 durante la batalla con Rusia por Tashkent, muchos soldados kokandis huyeron para unirse a Yaqub Beg, ayudándolo a establecer su dominio en toda la cuenca del Tarim, que duró hasta 1877, cuando los Qing reconquistó la región.Los visitantes occidentales quedaron impresionados por la ciudad de 80.000 habitantes, que contenía unas 600 mezquitas y 15 madrasas.Las insurrecciones contra el gobierno ruso y los impuestos opresivos de Khudayar lo obligaron a exiliarse en 1875.
El kanato de Kokand en 1860 y sus vecinos
Las fronteras de los territorios imperiales de Rusia de
Khiva
,
Bujará
y
Kokand
en el periodo posterior de 1902-1903.
