En 1178, Federico tuvo una nueva oportunidad y con el apoyo del emperador Barbarroja, en cuya corte permaneció, volvió a ser nombrado duque (la elevación del título de Bohemia como Reino no era hereditario).

Sin embargo, tan pronto como se fue, el depuesto duque Sobeslav II, que administró Bohemia de 1172 a 1178, intentó tomar Praga, pero Isabel dirigió su exitosa defensa.

Aun habiendo sido derrotado en el incluso después de haber sido derrotado en el río Loděnice,[1]​ sumó el apoyo de Conrado II Otón, que probablemente la princesa ayudó a ganar, finalmente derrotó a las fuerzas de Sobeslav en Praga.

La princesa emancipada puso su sello en los documentos principescos y fue consejera de Federico.

Sin embargo, su gobierno no tuvo éxito, porque el territorio checo se desintegró gradualmente en Bohemia, Moravia y el obispado de Praga.