Apoyó a Venancio Flores en su revuelta contra el presidente constitucional Bernardo Prudencio Berro, aunque fue desterrado a Buenos Aires en 1866, una vez hecho Flores con el poder.
Pedro Varela, hombre del mismo sector político que Isaac de Tezanos, asumió interinamente el poder con total apoyo candombero.
Latorre y Bustamante también integraron la nueva administración con cargos ministeriales.
Los principistas sindicaron siempre a de Tezanos como la verdadera eminencia gris del gobierno de Varela, sobre todo por las medidas represivas que tuvo frente a la oposición que estos integraban.
Sin embargo, no logró figuración posterior, muriendo poco tiempo después, a principios de 1886.