[4]​ Sin embargo, los rayos cósmicos ocupaban un importante puesto dentro de las investigaciones llevadas a cabo en esta institución, y eran supervisadas por Manuel Sandoval Vallarta, que para ese momento se encontraba trabajando en el Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT).

[4]​ Cabe destacar que, aunque en la planeación original del Instituto se consideraban múltiples líneas de investigación, en la práctica se lograron iniciar trabajos teóricos y experimentales sobre radiación cósmica.

[6]​ En el año de 1945, Carlos Graef asumió la dirección del Instituto y durante su gestión, se acrecentó la sección experimental cuando se adquirió un acelerador Van de Graaff, instrumento que dio origen a la era nuclear en México y contribuyó a la consolidación del Instituto de Física.

[6]​ Con el traslado del instituto a la Ciudad Universitaria, comenzaron las primeras experiencias en el acelerador Van de Graaff.

[3]​ Al final del periodo de dirección de Fernando Alba Andrade (1970) se reorganizó el instituto y se crearon cuatro departamentos: Estado Sólido, Colisiones, Física General y Física Teórica.