El minarete fue prolongado y la entrada al mismo, previo patio de las abluciones, se convirtió en la principal fachada del templo manteniendo su estructura mudéjar.

Como las obras de adaptación fueron lentas hasta el siglo XVIII se introdujeron diversos elementos y estilos en la Iglesia.

Como por ejemplo un altar mayor dieciochesco, o un artesonado de clara tendencia mudéjar.

El templo presenta planta basilical, con tres naves separadas por arcadas sustentadas en columnas.

(Como referencia se cita que en Sevilla capital, el Cristo documentado más antiguo que procesiona en toda su Semana Santa es el Santísimo Cristo de Burgos, realizado cinco décadas más tarde, en el año 1574, por Juan Bautista Vázquez El Viejo).