ILGA-Europa se fundó en 1996, cuando su organización matriz, la Asociación Internacional de Lesbianas, Gays, Bisexuales, Trans e Intersexuales, estableció regiones independientes.
[4] Esto permitió a ILGA-Europa establecer una oficina en Bruselas, contratar personal permanente y llevar a cabo un amplio programa de trabajo en relación con la discriminación por orientación sexual en los Estados miembros de la UE y los países candidatos.
[4] ILGA-Europa organiza su conferencia anual a finales de octubre, desde el año 2000, en la que las organizaciones miembros eligen la junta ejecutiva y deciden las prioridades de trabajo para el año siguiente.
Cada mes de mayo, ILGA-Europa publica su revista Rainbow Europe, para conmemorar el Día Internacional contra la Homofobia y la Transfobia.
[17] El deterioro más significativo de los derechos LGBTI se da en el Reino Unido, que ha disminuido 33 puntos porcentuales desde un pico del 86% en 2015.
[16] [18] Para incluir a las personas intersexuales en su ámbito de competencias, ILGA-Europa e ILGA han patrocinado conjuntamente la única reunión internacional de activistas y organizaciones intersexuales.