En la cuenca alta es donde recibe los principales afluentes: río Aguas Limpias (regulado por el pantano de la Sarra), Caldarés, Escarra, Lana Mayor y Aurín, que son los que determinan en gran parte el caudal y las características del río Gállego.En su tramo alto se practica piragüismo en aguas bravas al igual que en sus afluentes el Caldares y el Escarra.Aguas abajo de este punto comienza el Bajo Gállego.La cabecera del río está protegida como zona especial de conservación (ZEC) por su valor ambiental.Fuentes oficiales han calculado que entre 1975 y 1989 fueron arrojadas entre 115 000 y 160 000 toneladas de residuos tóxicos desde dos vertederos en Sabiñánigo, que de alguna forma se filtraron parcialmente al río.