[1]​ Su cuenca se denomina la Guarguera y su trazado discurre íntegramente por la Comarca Alto Gállego.

El hidrónimo Guarga se documenta en fuentes aragonesas desde el año 1136, y a partir de 1202 se empleó para designar a una circunscripción eclesiástica, la de 'Gorga'.

Antonio Ubieto Areta sugiere que es un topónimo bereber que indicador la presencia de bereberes de Fez en el siglo VIII con base en la existencia de un río Warga cerca del río Sebú.

Otras teorías lo derivan del latín 'Gurga', con el significado de garganta.

Discurre por la comarca natural de la Guarguera, a la que da nombre.