La duquesa Dorotea Susana no pudo impedir que el elector Augusto de Sajonia -de la línea albertina- fuera nombrado regente en lugar de ella.
En 1586, Federico Guillermo fue declarado adulto y empezó su gobierno independiente sobre Sajonia-Weimar.
Esto lo asumió su hermano menor, Juan, que tenía que intervenir -de acuerdo con la ley de la línea ernestina- de todas formas en el gobierno.
En 1601, terminó la regencia en el Electorado de Sajonia con la mayoría de edad del elector Cristián II, y Federico Guillermo regresó a Weimar.
Sin embargo, murió un año después y no dejó suficiente huella en la historia del ducado.