El 4 de agosto de 1998 el Levante UD absorbe oficialmente al San Vicente Valencia CFF, que se convierte en una sección más del club granota, pasando a denominarse Levante Unión Deportiva Femenino y adoptando sus colores, escudo y distintivos.El equipo gana todos los partidos disputados en la liga regular, con unas estadísticas de récord: 240 goles a favor y tan solo 5 en contra.La siguiente temporada el Levante afianzó su dominio en el fútbol femenino español conquistando nuevamente el doblete: la Copa de la Reina y la Superliga.La temporada 2006-07 llegó al banquillo Félix Carballo, que en su primer año consiguió sumar un nuevo título copero.Pero esta vez el Rayo le gana la partida a un Levante que empezó la temporada con un nuevo entrenador (José Arastey) pero que le cedió su testigo en Navidad por motivos personales a Gustavo Duco, exentrenador del filial femenino y coordinador de la cantera.