Eorhynchochelys es notable por tener un pico desdentado característico.

Sin embargo, la región del tórax es notablemente diferente a la de Pappochelys y Odontochelys, las costillas eran anchas y planas, no tenía caparazón como las verdaderas tortugas.

[1]​ Su cráneo por lo general tiene una fosa temporal (configuración Euryapsida) igual a la de los sauropterigios o ictiosaurios, a diferencia de Eunotosaurus y Pappochelys que tenían dos fosas temporales (configuración Diapsida).

Las razones por las cuales perdieron las fosas temporales no están todavía resueltas es posible que se daba al desarrollo de los escudos o caparazones.

[3]​ Una posible filogenia es la siguiente: Lepidosauria Choristodera† Trilophosauria† Rhynchosauria† Euparkeriidae† Crocodilia Pterosauria† Dinosauria (incluye las aves) Eosauropterygia† Sinosaurosphargis† Placodontia† Eunotosaurus† Pappochelys† Eorhynchochelys† Odontochelys† Proganochelys† Testudines (solo tortugas actuales)