[2]​[3]​[4]​ El sitio llegaría a su máximo esplendor a finales del período preclásico tardío (entre 200 a. C. y 200 d. C), cuando se construiría la estructura E3-1-1a, así como la plaza donde se construiría el resto de estructuras ampliándose el centro ceremonial hasta la zona del sitio arqueológico Casa Blanca.

[6]​[7]​ El Trapiche se encuentra ubicado cerca del río homónimo (afluente del río Pampe), encontrándose en un primer momento (en la década de 1940s), dentro de 2 propiedades privadas: Finca San Antonio y Beneficio Las Victorias.

[3]​ Consta de unas 10 estructuras, cuya denominación arqueológica generalmente empieza con la expresión E3; y que junto con las de Casa Blanca conformaban un mismo centro ceremonial y habitacional.

[4]​ Monumentos que, según Robert Sharer, fueron encontrados en la base de la estructura pero que se desconoce su ubicación original son los llamados monumentos 6 (cuenco o metate gigante, probablemente de uso ceremonial), 8 (estela o altar con un elemento glifico completo) y 9 (piedra con ranuras).

[22]​ Enfrente de esta estructura se encontró un fragmento de estela con la inscripción 7 baktún (que corresponde entre el 354 a. C. y 41 d. C.), este fragmento se encontraba en un hoyo (del piso original) relleno de piedras con las inscripciones hacia arriba, este hoyo sería después rellenado con piedras para construir otro piso encima.

[4]​[5]​[7]​ Las estructuras E3-3 y E3-6, fueron las primeras en ser excavadas en el sitio, durante las investigaciones realizadas por William R. Coe en 1954.

[24]​ La estructura E3-4 mide 3 metros de alto; se encuentra alineada con las estructuras E3-2 y E3-3, siendo la más pequeña y la que se encuentra más al poniente de las tres.

[28]​[5]​ Había sido sumamente afectada debido a las plantaciones de la finca donde se encontraba, siendo demolida la entera mitad occidental y parte de su lado norte antes que el sitio fuese renocido en 1944 por Longyear y Boggs.

[31]​ William Sharer incluye, dentro de este sitio, a las estructuras E5-2 y G1-1.

[29]​ Durante las fases Kal (650 a. C. - 400 a. C.) y Chul (400 a. C. - 200 a. C.) se extendieron las actividades domésticas y ceremoniales hacia otras áreas de Chalchuapa; sin embargo, en El Trapiche no hay evidencia de modificaciónes a la estructura E3-1-2a.

Paulatinamente el centro ceremonial se extendería, abriendo nuevas estructuras (como la E3-7 y 8) y se construiría la gran plataforma en la que están ubicadas las estructuras de Casa Blanca.

[29]​ En la fase Vec (200 d. C - 400 d. C) aconteció la decadencia del sitio, lo cual sucedió probablemente por la decadencia y colapso de los demás sitios principales del preclásico (como Kaminaljuyú), y por lo tanto el cambio en el vínculo político y económico de la esfera cultural Providencia-Miraflores a Copán; así como la influencia directa o indirecta de Teotihuacán.

Provocando, todo ello, el traslado del centro político y económico de la población al Tazumal.

[7]​[21]​ El sitio, al parecer, continuaría en funcionamiento hasta la erupción del actual Lago de Ilopango, que sucedió en algún punto entre los siglos IV, V, o VI d. C. Luego de ello, se colocaría en la ceniza depositada el monumento 10 y un cántaro del grupo-variedad Guazapa engobe raspado; por lo que las actividades humanas como la peregrinación ancestral continuarían en el sitio; asimismo, algunas estructuras pequeñas como la E3-9 datarían de este período.