En 1936, el convento fue convertido en cárcel y la reliquia profanada, no padeciendo daños los restos sepultados entre las dos capillas de la cripta.Al lado izquierdo del crucero y muy próximo al altar se ubica una lauda funeraria donde actualmente descansan los restos mortales de Alonso de Ercilla.En tres de los lados, existen vanos ciegos mediante tabiquería dejando una reducida ventana.La galería superior está abierta y se descansa sobre pies derechos de madera con zapata, viga corrida y una balaustrada de madera.El patio posee bajo su solado un espléndido aljibe que pese al tiempo aún trabaja.
