El Colegio de San Bernardo es un edificio colonial ubicado en la ciudad del Cusco, Perú.

El solar donde actualmente se levanta el Colegio de San Bernardo se entregó originalmente a Alonso de Toro (cuya casa aún se encuentra en pie en la esquina de las calles Marqués y San Bernardo) y posteriormente a Tomás Vasquez[3]​.

Muchas familias acaudaladas que simpatizaban con los jesuitas adquirieron inmuebles y se los donaron.

Las principales donaciones correspondieron a Diego de Silva y su esposa Tereza Orgóñez[4]​.

No obstante, se mantuvo su tradición en el actual Colegio Ciencias cuyo patrón sigue siendo San Bernardo.

Antiguamente existía, más al interior, una segunda capilla llamada de Loreto.

En la puerta principal el frontón se abre en forma semicircular dejando amplió tímpano donde está tallado un escudo.