La Historia del Colegio Mayor corre pareja a la de la Universidad Complutense.

[6]​ La Guerra Civil interrumpió las obras apenas iniciadas y el arquitecto Lacasa fue depurado junto con los también arquitectos Manuel Sánchez Arcas y Bernardo Giner de los Ríos los tres condenados con inhabilitación perpetua para el ejercicio de su profesión en acuerdo posteriormente dejado sin efecto ya en la democracia[7]​) y hubo de partir para el exilio.

Finalizada la contienda, se reanudaron las obras ya bajo la dirección del arquitecto Javier Barroso y Sánchez-Guerra.

El Colegio Mayor se divide en un edificio central de tres plantas con los servicios comunes.

Unidos al pabellón central mediante un pasaje cubierto hallan las dependencias para habitaciones de colegiales.

Originalmente, el Colegio contaba con dos pabellones (tradicionalmente denominados "Argüelles" y "Moncloa" por ser contiguos, como los barrios de Madrid homónimos y próximos al colegio) pero en el curso 1990-1991 un bloque de habitaciones que había pertenecido al cercano Colegio Mayor Diego de Covarrubias fue adscrito al CMU Nebrija (por esa razón, y por coincidir la adscripción con la 1.ª Guerra del Golfo, se conoce entre los Colegiales como “Kuwait”, denominación que hizo fortuna y que se mantiene desde entonces).